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Results
Showing 1 to 20 of 23 for “"Transkriptom"”.
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Genomweite Transkriptionsanalyse von Methanosarcina mazei Gö1
… zu generieren, die das gesamte Transkriptom von Methanosarcina mazei Gö1 repräsentieren.Ferner wurde eine TOPO-Plasmidbank des Transkriptoms von Ms. mazei Gö1 erstellt, die es ermöglichte neue hoch spezifische PCR-Produkte zu generieren, und damit in Zukunft die Nachproduktion …
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Studien der Genexpressionsänderung während der Entwicklung von Drosophila melanogaster mittels DNA-Microarrays
… auf experimentellen Nachweisen beruhen. Um das Transkriptom von Drosophila im Verlauf der Entwicklung zu untersuchen und neue potentielle Gene zu identifizieren wurde im Rahmen dieser Arbeit ein DNA-Microarray entwickelt, mit dem Veränderungen in der mRNA-Expression analysiert wurden. Auf der …
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Functional Genome Analysis of Mycobacterium tuberculosis
… werden. Mit denselben DNA-Arrays wurden weitere Transkriptom-Analysen der Genexpressionsprofile von M. tuberculosis durchgeführt, die aus Makrophagen und Gewebematerial der menschlichen Lunge isoliert worden waren. Die DNA-Array-Untersuchungen zeigten ein charakteristisches Muster von aktiver …
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Die Funktion des BAG1-Proteins ist abhängig von seiner subzellulären Verteilung
… Ergebnisse könnte hier beispielsweise eine Transkriptom- und Proteomanalyse der verschiedenen BAG1-Formen liefern.
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Analyse der Struktur, Funktion und Evolution der Astacin-Protein-Familie
… Genen identifiziert werden. Eine Transkriptom-Analyse ergab, dass mit Ausnahme eines Pseudogens alle anderen Astacine tatsächlich exprimiert werden. GFP-Reporter-Proteine zeigten für zwei Astacine eine Verdauungsfunktion und eine entwicklungsrelevante Rolle. Bei einer …
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Untersuchungen zur Physiologie des Essigsäurebakteriums Gluconobacter oxydans 621H
… sind. Im Rahmen dieser Arbeit wurde das Transkriptom von G. oxydans 621H nach Wachstum unter verschiedenen Bedingungen untersucht. Hierzu wurde auf Basis der Genomsequenz ein Microarray konstruiert, das 94 % der 2664 Open Reading Frames (ORFs) abdeckt. G. oxydans 621H wurde in …
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The inducible antiviral immune response of Drosophila melanogaster
… mit Hilfe von genomweiten microarrays das Transkriptom von Fliegen, welche entweder mit dem Drosophila C Virus (DCV), dem Flock- house Virus (FHV) oder dem Sindbis Virus (SINV) infiziert waren. Infektion mit diesen drei positiv orientierten Einzelstrang RNS Viren führte zu einer starken …
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Charakterisierung von Scp160p, einem mRNA- und ribosomenassoziierten Protein in Saccharomyces cerevisiae
… Scp160p zu charakteristischen Veränderungen im Transkriptom und zu einer Verschiebung spezifischer mRNA-Signale zwischen einer membranangereicherten und einer zytosolischen Fraktion führt. Diese Veränderungen betreffen insbesondere mRNAs, die für Proteine kodieren, die in den sekretorischen Weg …
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Regulation of gene expression and adhesion in <i>Saccharomyces cerevisiae</i>
… Ein Vergleich mit den entsprechenden Transkriptom-Daten ergab, dass unter Aminosäuremangel nur die mRNA Menge des HIS1-Gens signifikant erhöht ist. In Hefezellen führt eine Deletion des CPC2-Gens, welches für ein hoch konserviertes G?-artiges WD-Protein kodiert, zu einem Verlust der …
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Untersuchungen zur Pathogenese der dilatativen Kardiomyopathie in Cathepsin L-defizienten Mäusen
… Mäusen führen, näher zu analysieren, wurde das Transkriptom von CTSL-Wildtyp und knockout Mäusen im Alter von 2 und 12 Monaten untersucht und per real time PCR verrifiziert. Die Daten zeigen, neben differentiell exprimierten Genen für Proteine der extrazellulären Matrix, Transkription, …
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Role of Gcn4p in nutrient-controlled gene expression in Saccharomyces cerevisiae
… eher untergeordnete Rolle. Durch vergleichende Transkriptom-Analyse eines Hefe-Wildtyp-Stammes und eines gcn4D-Deletionsstammes, die unter Aminosäure-Mangelbedingungen gewachsen waren, konnten 225 Gene identifiziert werden, die unter Aminosäure-Mangelbedingungen Gcn4p-abhängig induziert werden. …
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Identifiying Casc15 as a novel regulator of progenitors’ proliferation and neuronal migration in the developing neocortex
… das zuvor in unserem Labor erzeugt wurde: ein Transkriptom von einer Mauslinie, die es ermöglicht, proliferierende, differenzierende und ausdifferenzierte Zellen zu sortieren. Die Analyse der differentiellen Expression von lncRNAs in den drei Zelltypen enthüllte interessante Kandidaten, die …
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Bioinformatische Analyse der NUGAT-Studie (NUtriGenomic Analysis in Twins)
… erhöht. Letzteres unterstützt die Beobachtung im Transkriptom des weißen, subkutanen Fettgewebes, bei der eine Aktivierung der über die Toll-like receptors und das Inflammasom vermittelten subklinischen Inflammation beobachtet werden konnte. Die auftretenden Veränderungen in Konzentration und …
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Etablierung und Charakterisierung einer Tetracyclin-induzierbaren PHD2-Knockdown-HeLa-Zelllinie
… 2.1.1-16 genutzt, um PHD2-abhängige Transkriptom- und Proteomveränderungen (Gen-Array und 2D-Gelelektrophorese) zu untersuchen. In der Transkriptomanalyse konnten 7 Gene identifiziert werden, die in Abhängigkeit von dem PHD2-Knockdown unterschiedlich exprimiert werden, jedoch nicht …
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Profiling the inherent vulnerability of motor neuron subtypes
… identifizieren. Um dies zu erreichen, wurde eine Transkriptomanalyse von anfälligen versus resistenten MN-Subtypen durchgeführt. Zunächst umfasste dies die Identifizierung des Transkiptoms jener MN, welche den M. Rectus femoris (RF) innervieren, ein überwiegend schneller Muskel, innerviert von …
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Integrative transcriptomic approaches to analyzing plant co-expression networks
It is well documented that transcriptionally coordinated genes tend to be functionally related, and that such relationships may be conserved across different species, and even kingdoms. (Ihmels et al., 2004). Such relationships was initially utilized to reveal functional gene modules in yeast and …
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Molekularbiologische Untersuchungen zur Eignung Virulenz-relevanter Faktoren als Zielstrukturen für die Entwicklung neuer Antibiotika gegen Staphylococcus aureus
… des wildtypischen Phänotyps. Die Transkriptomanalyse der dclpP-Mutante ergab eine deutliche Veränderung in der Genexpression (15 % aller Gene). Eine computerunterstützte Analyse der Upstreambereiche der deregulierten Gene führte zu der Identifizierung verschiedener Regulons, die …
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Identifizierung und funktionelle Charakterisierung von für die arbuskuläre Mykorrhizasymbiose spezifischen Genen in Medicago truncatula
Die Mykorrhiza (griechisch: mýkēs für „Pilz”; rhiza für „Wurzel”) stellt eine Symbiose zwischen Pilzen und einem Großteil der Landpflanzen dar. Der Pilz verbessert durch die Symbiose die Versorgung der Pflanze mit Nährstoffen, während die Pflanze den Pilz mit Kohlenhydraten versorgt. Die …
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Analyse des Transkriptoms von Neisseria meningitidis Serogruppe B mit DNA-Microarrays
… Oligonukleotid-basierten Microarray-Systems zur Transkriptomanalyse von Neisserie meningitidis Serogruppe B wurde im Vergleich mit einem cDNA-basierten System demonstriert. Hierzu wurde für ein Subset von 60 Genen die Eigenschaften anhand von Parallelhybridisierungen sowie eines vormals …
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