Random walks in the stringent response

Poomisvastus on võtmetähtsusega adaptiivsete mehhanismide regulatsioonil, mis aitavad bakteritel ebasoodsaid keskkonnatingimusi üle elada. Soolekepikeses (Escherichia coli) on selles protsessis oluliseks ensüümiks RelA, mis vastusena aminohappenäljale sünteesib signaalmolekuli (p)ppGpp. See signaalmolekul mõjutab transkriptsiooni, translatsiooni ja rakkude jagunemist. Meie töötasime välja ühe molekuli jälgimise mikroskoopia metoodika, mis võimaldab mõõta molekulide difusiooni rakus. Kasutasime seda metoodikat erineva kiirusega liikuvate molekulide kirjeldamiseks. Rakus vabalt difundeeruva valgu näiteks oli fluorestseeruv valk mEos2. Hoopis teistsuguste omadustega valguks osutus mitokondri membraanivalk Tom40, mille liikumine on ühte asukohta piiratud. RelA puhul täheldasime nii vabu, kiirelt difundeeruvaid molekule kui ka ribosoomile seondunud ja seetõttu aeglaselt liikuvaid molekule. Kombineerides ühe molekuli jälgimise tulemusi biokeemiliste andmetega, pakume välja RelA valgu töötsükli mudeli. Kuhjuv (p)ppGpp põhjustab samuti RelA aktivatsiooni. Sellisel viisil tekib positiivse tagasisidestusega regulatsioonisüsteem ja signaalmolekuli kontsentratsioon tõuseb kiiresti.

Author dc:creator

• Tankov, Stoyan

Advisors dc:contributor.advisor

• Tenson, Tanel, juhendaja
• Hauryliuk, Vasili, juhendaja

• valgud
• translatsioon (biol.)
• ensüümid
• molekulid
• proteins
• translation (biol.)
• enzymes
• molecules

Language dc:language.iso

en

Identifier

hdl:10062/54357

OAI record oai:identifier

http://dspace.ut.ee/oai/request?verb=GetRecord&metadataPrefix=dim&identifier=oai%3Adspace.ut.ee%3A10062%2F54357