Exploring the genomics of cognitive impairment: whole-genome SNP genotyping experience in Estonian patients and general population

Intellektipuue on raske arenguhäire, mis arenenud riikides esineb ligikaudse sagedusega 2% üldpopulatsioonist. Intellektipuude tekkepõhjused võivad olla väga erinevad ning ligi pooltel patsientidest on häire põhjus jäänud koguni teadmata. Viimastel aastatel teaduses kasutusele võetud kogu-genoomi analüüsimeetodid on näidanud, et inimgenoomis esinevad laialdaselt DNA koopiaarvu variatisoonid (CNV) - kromosoomsegmendid, mille koopiate arv on ümberkorralduse tõttu genoomis tavapärasest suurem või väiksem. On leitud, et CNV-d võivad olulisel osal patsientidest vastutada intellektipuude ja teiste kaasasündinud arenguhäirete eest ning olla riskifaktoriks erinevate komplekshaiguste kujunemisel. Samas esinevad CNV-d ka (näiliselt) tervetel inimestel, mis muudab nende kliinilise tähtsuse hindamise sageli keeruliseks ning enamuse CNV-de mõju inimese tervisele ja arengule on praegusel ajal veel ebaselge. Käesolev töö on esimene ulatuslik uurimus CNV-de haigusseoselisest rollist intellektipuudega Eesti perekondades. Kuna rea genoomsete muutuste puhul võib nende mõju haigustunnuste avaldumisele olla varieeruv, teostati CNV-de täpsema rolli analüüsimiseks sama uuring ka Tartu Ülikooli Eesti Geenivaramu geenidoonoritele. Töö tulemusena leiti 18 peres intellektipuuet põhjustav CNV ehk geneetiline diagnoos määrati 23% uuritud patsientidest, kellel seni oli nende haiguse põhjus teadmata. Eesti Geenivaramu geenidoonorite hulgast leiti neuropsühholoogiliste häiretega seotud CNV-d 19 indiviidil. Vastavalt Eesti Geenivaramu küsimustikule on enamus neist inimestest kannatanud aastaid erinevate tervisehäirete (näiteks tugev rasvumine, epilepsia, kõnearengu häired, depressioon, teised neuroloogilised ja psühhiaatrilised probleemid) teadmata, et nende genoomis esineb vastavate haiguste riski suurendavaid variatsioone. Samuti oli uuringuandmetel oluline roll kahe kromosoomregiooniga, 7q11.23 ja 16p11.2, seotud uute genoomsete sündroomide iseloomustamisel. Kokkuvõtlikult näitas käesolev uuring CNV-de olulist rolli neuropsühholoogiliste häirete kujunemisel ning genoomse analüüsi efektiivsust teaduses ja diagnostikas.

Author

• Männik, Katrin

• vaimne alaareng
• DNA koopiaarvu variatsioonid
• geeniuuringud
• kromosoomid
• populatsioonigeneetika
• mental retardation
• DNA copy number variations
• genetic research
• chromosomes
• population genetics

Identifier

hdl:10062/26095

OAI identifier oai:identifier

oai:dspace.ut.ee:10062/26095