Desarrollo de un método de detección sensible y específico de Pseudomonas syringae pv. syringae y Pseudomonas syringae pv. morsprunorum en cerezos

Las bacterias Pseudomonas syringae pv. syringae (Pss) y Pseudomonas syringae pv. morsprunorum (Psm) afectan al cerezo, especialmente a plantas jóvenes, y causan pérdidas económicas importantes a nivel mundial. Para contrarrestar esta situación, una de las medidas es poder contar con herramientas sensibles y específicas que permitan realizar una identificación rápida. Este trabajo tiene como objetivo desarrollar un protocolo de detección basado en la técnica molecular denominada Loop-mediated isothermal amplification (LAMP). A partir de la secuencia del genoma de aislados bacterianos obtenidos de material vegetal de cerezo sintomático, colectados en cuatro regiones del país, en conjunto con secuencias disponibles de Genbank, se identificaron regiones genómicas únicas para cada una de las bacterias, las que se utilizaron para el diseño de partidores específicos para LAMP. Éstos se validaron utilizando aislados purificados de diferentes Pseudomonas, incluidos Pss y Psm, determinando la sensibilidad y especificidad de la técnica. Se completó la validación detectando las bacterias directamente en material vegetal, sin previa purificación de los aislados. En conclusión, el protocolo LAMP desarrollado en este proyecto permite la identificación sensible y específica de Pss y Psm.

Grantor dc:publisher

Universidad de Chile

Year dc:date.issued

2022

Author dc:creator

• Díaz Leal, Daniela Paz

Advisors dc:contributor.advisor

• Fiore ., Nicola
• Zamorano Carrasco, Alan Gerardo

• Análisis filogenético
• Análisis multilocus de secuencia (MLSA)
• Average Nucleotide Identity (ANI)
• PCR
• Secuenciación masiva
• Multilocus sequence analysis (MLSA)
• Next Generation Sequencing (NGS)
• Phylogenetic Analysis

Statement dc:rights

• Attribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 United States

Licence dc:rights.uri

• http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/us/

Language dc:language.iso

es

Dc Identifier Other

10.58011/rdgp-7x41

OAI identifier oai:identifier

oai:repositorio.uchile.cl:2250/200640