Genotypic and phenotypic characterization of an almond germplasm collection for biotic and abiotic stress [Caratterizzazione genotipica e fenotipica di una collezione di germoplasma di mandorle per lo stress biotico e abiotico]

Il mandorlo (Prunus dulcis (Miller) DA Webb, sin. P. amygdalus Batsch) è una delle specie di frutta secca più coltivata al mondo; il seme e i suoi prodotti derivati sono ampiamente consumati e apprezzati. P. dulcis è caratterizzato da una grande biodiversità e le specie locali rappresentano un’importante risorsa genetica a cui attingere per i programmi di miglioramento genetico grazie a caratteri di tolleranza a diversi stress biotici e abiotici. L’obiettivo principale di questo PhD è di valorizzare e sfruttare le accessioni di mandorlo siciliani locali per la ricerca di genotipi tolleranti a stress biotici (fungo Diaporthe amygdali) e abiotici (siccità). Per fare questo, 123 genotipi siciliani e cultivar di importanza nazionale ed internazionale sono stati caratterizzati geneticamente mediante l’AxiomTM 60K Almond SNP Array. Questa analisi ha permesso di identificare 6,374 SNPs unici, di cui 16 SNPs capaci di discriminare una o (in alcuni casi) un gruppo di individui. In parallelo è stato messo a punto un protocollo di rintracciabilità del mandorlo e dei suoi prodotti derivati, mediante l’estrazione di DNA di sufficiente qualità per l’impiego di marcatori molecolari. Questi risultati possono contribuire a valorizzare alcuni prodotti di nicchia (per esempio il marchio collettivo “Mandorle di Avola”) e tutelare i consumatori da frodi alimentari. La suscettibilità al cancro dei rami è stata valutata tramite un saggio su rametto distaccato, e la lunghezza della necrosi rilevata sui rami è stata utilizzata come dato fenotipico per lo studio di associazione genotipo-fenotipo. Nove SNPs (Single Nucleotide Polymorphisms) sono stati significativamente associati alla tolleranza/suscettibilità al patogeno. Inoltre, venti geni candidati sono stati ulteriormente validati tramite Real-Time PCR sul genotipo più tollerante (‘Cuti’) e più suscettibile (‘Ferraduel’). Allo stesso tempo, 78 genotipi della collezione sono stati sottoposti a stress idrico per 13 giorni. Per valutare l’andamento dello stress, su un sottoinsieme di 5 genotipi, sono stati misurati gli scambi gassosi e il potenziale idrico fogliare. La risposta allo stress idrico dei 78 genotipi è stata valutata attraverso la determinazione dell’indice di clorofilla e i livelli di malondialdeide e di prolina; inoltre, nell’ultimo campionamento, è stato valutato il livello di danno raggiunto tramite una scala di valutazione fenotipica. Questa prova ha verificato il grado di tolleranza allo stress delle varietà e identificato dei genotipi tolleranti (‘Cumma’, ‘Mennula du Vattiu’, ‘Persichina’ e ‘Tuono’); inoltre, i diversi parametri analitici misurati sono stati correlati con la capacità di risposta dei genotipi allo stress idrico. Come dimostrato nei nostri studi, la collezione di germoplasma mandorlicolo siciliano rappresenta una valida risorsa per rispondere alle esigenze colturali legate alle sfide poste dai cambiamenti climatici.

Grantor dc:publisher

Università degli studi di Catania

Year dc:date

2026

Author dc:creator

• INZIRILLO, Ilaria

Contributors dc:contributor

• DE PINTO, Vito Nicola

• Prunus dulci
• unique SNP
• Diaporthe amygdali
• Traceability
• Drought
• Tolerance
• GWAS
• Biodiversity
• SNP unici
• Tracciabilità
• Siccità
• Tolleranza
• Biodiversità

Statement dc:rights

• info:eu-repo/semantics/embargoedAccess
• license:NON PUBBLICO - Accesso privato/ristretto
• license uri:iris.PRI01

Language dc:language

eng

Handle dc:identifier

https://hdl.handle.net/20.500.11769/724383

OAI identifier oai:identifier

oai:www.iris.unict.it:20.500.11769/724383