Programación de una librería de Python capaz de leer ficheros PDB para representar proteínas en 3D

Este proyecto tiene como finalidad el uso de librerías de Python para la visualización de estructuras proteicas tridimensionales mediante el procesado de archivos PDB. Para ello, se utilizaron las herramientas ofrecidas por BioPython para el procesado de datos, y las librerías matplotlib y VisPy para la visualización de los datos procesados. El resultado de este trabajo es un programa cuya interfaz gráfica fue creada mediante la librería Tkinter, que permite la selección del archivo a representar, la selección del motor que se utilizará para la visualización y qué tipo de visualización se generará (CPK, según el tipo de aminoácido al que pertenece, dividido en cadenas, y usando DSSP). Para facilitar su uso, también se pueden utilizar los motores por separado en forma de paquetes individuales, MatViewer y VisPyViewer (2D y 3D). Este trabajo se puede utilizar como plataforma para generar nuevas alternativas a los visualizadores existentes, dado que tienen una gran capacidad de personalización, sobre todo gracias a la librería VisPy.

Grantor dc:publisher

Universitat Oberta de Catalunya

Year dc:date.issued

2018

Author dc:creator

• Cabrelles Muñoz, Aldar

• Python
• PDB
• proteins
• proteínas
• proteïnes

Licence dc:rights.uri

• http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/3.0/es/

Language dc:language.iso

spa

Handle dc:identifier.uri

https://hdl.handle.net/10609/81729

OAI identifier oai:identifier

oai:openaccess.uoc.edu:10609/81729