Análise comparativa de transposons classe II (CACTA e Mutator) nos genomas de Vigna unguiculada, Phaseolus vulgaris e Medicago truncatula

Os elementos transponíveis (TEs) são sequências móveis de DNA, presentes em quase todos os organismos já estudados. Constituem parte abundante dos genomas, influenciando em sua estrutura e atividade de diversas maneiras. Dessa forma, conhecer a composição e a distribuição de TEs em leguminosas como Vigna unguiculata, Phaseolus vulgaris e Medicago truncatula é parte importante do conhecimento da influência destes nos genomas vegetais. Usando ferramentas bioinformáticas baseadas em homologia, esse trabalho identificou um total de 5,64 Mb de transposons e 48,42 Mb de retrotransposons, distribuídos em todos os cromossomos de P. vulgaris; 14,04 Mb de transposons e 51,20 de retrotransposons em M. truncatula, e 2,38 Mb e 9,34 Mb de transposons e retrotransposons, respectivamente, em V. unguiculata. Todos apresentaram CACTA e Mutator entre as três superfamílias de transposons mais abundantes no genoma. Além disso, a identificação de transcritos em cultivares contrastantes quanto à tolerância à seca em V. unguiculata mostrou que a cultivar tolerante apresentou maior número de transcritos de CACTA e Mutator que a cultivar susceptível. Interessantemente apesar de possuir o menor genoma, M. truncatula foi a leguminosa com maior quantidade de TEs, possivelmente por sua maior tolerância à atividade destes elementos ou menor controle epigenético. Por outro lado, a despeito dos riscos inerentes à sua atividade, a maior abundância de transcritos na cultivar tolerante à seca de V. unguiculata indica que a atividade dos TEs pode conferir uma vantagem evolutiva.

Grantor dc:publisher

Universidade Federal de Pernambuco

Year dc:date.issued

2015

Author dc:creator

• MOURA, Bruna Piereck

Advisor dc:contributor.advisor

• BRASILEIRO VIDAL, Ana Christina

• Genética vegetal
• Feijão

Statement dc:rights

• openAccess
• Attribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 Brazil

Licence dc:rights.uri

• http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/br/

Language dc:language.iso

por

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https://repositorio.ufpe.br/handle/123456789/31347

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