Transkrypcyjna i potranskrypcyjna regulacja biogenezy mikroRNA u Arabidopsis thaliana

MikroRNA zostały zidentyfikowane u prawie wszystkich przedstawicieli grup organizmów eukariotycznych i są uważane za fundamentalne elementy regulacji ekspresji genów. Wiele roślinnych genów mikroRNA zawiera introny. Wiadomo, że obecność intronów w genach kodujących białka bardzo często prowadzi do alternatywnego splicingu pre-mRNA, a co za tym idzie, do zwiększenia różnorodności powstających białek z jednego genu. Odnośnie genów MIR funkcjonalną cząsteczką jest krótki (19-24 nt) RNA. Występowania intronów w takim przypadku nie można wytłumaczyć możliwością zwiększenia repertuaru kodowania różnych mikroRNA. Potwierdzają to wyniki sekwencjonowania całkowitej puli krótkich RNA u Arabidopsis thaliana. Postawione zostało pytanie: czy obecność intronów w genach i pierwotnych transkryptach tych genów ma wpływ na poziom dojrzałych cząsteczek miRNA? W pracy tej, na podstawie dwóch przykładów genów MIR zawierających introny, (MIR163 i MIR161) wykazano, że introny w genach MIR są istotne do prawidłowej ekspresji dojrzałych cząsteczek mikroRNA.Usunięcie sekwencji intronu z genu MIR prowadzi do obniżenia ekspresji dojarzałej cząsteczki mikroRNA pochodzącej z danego genu. Efekt stymulacji dojrzewania mikroRNA jest związany przede wszystkim z funkcjonalnym miejscem 5’ splicingowym. Dodatkowo mutacja miejsca splicingowego 5` prowadzi do zaburzenia w wyborze miejsca poliadenylacji w pierwotnym transkrypcje genu MIR. Ponadto obecność miejsc splicingowych w pierwotnym transkrypcie genu MIR163 okazała się niezbędna w odpowiedzi rośliny na stres biotyczny. Brak miejsc splicingowych podczas ataku patogena nie wywołuje stymulacji ekspresji mikroRNA163, co w konsekwencji prowadzi do nieprawidłowej regulacji genu docelowego działania dla tego mikroRNA.

Author dc:creator

• Bielewicz, Dawid

Advisors dc:contributor.advisor

• Szweykowska-Kulińska, Zofia. Promotor
• Vazquez, Franck. Promotor

• mikroRNA
• splicing
• transkrypcja

Statement dc:rights

• info:eu-repo/semantics/openAccess

Language dc:language.iso

en

Identifier

hdl:10593/13315

OAI record oai:identifier

https://repozytorium.amu.edu.pl/server/oai/request?verb=GetRecord&metadataPrefix=dim&identifier=oai%3Arepozytorium.amu.edu.pl%3A10593%2F13315