Kultivierungsabhängige Analyse mikrobieller Gemeinschaften in Sapropelen des östlichen Mittelmeeres

In Sedimenten des östlichen Mittelmeeres treten in regelmäßigen Abständen Sapropele auf. Diese organisch reichhaltigen Schichten sind durch erhöhte Zellzahlen und mikrobielle Aktivitäten gekennzeichnet. In der vorliegenden Arbeit konnten mit Hilfe verbesserter Kultivierungstechniken bis zu 3,3 % der mikrobiellen Gemeinschaften der Sapropele angereichert und eine große Stammsammlung etabliert werden (27 Phylotypen aus 6 bakteriellen Gruppen). Für einen häufig isolierten Phylotypen, Rhizobium radiobacter, wurde ein spezifisches PCR-basiertes Nachweissystem entwickelt. Die Untersuchung von 45 Sedimentproben zeigte die weite Verbreitung und hohe Abundanz dieses Mikroorganismus in situ (bis zu 5% der Bakterien). Hohe Zelldichten von R. radiobacter in Sapropelen und seine Anwesenheit in Wasserproben des Nils weisen auf einen möglichen terrestrischen Ursprung hin. Physiologische und genetische Untersuchungen ausgewählter Isolate zeigten verschiedene Anpassungen an die Bedingungen in den Sapropelen. Zudem wurde deutlich, dass Mikroorganismen verschiedene Strategien verfolgen, um Ihr Überleben in diesem speziellen Habitat zu sichern.

Level thesis:degree_level

thesis.doctoral

Grantor dc:publisher

Universität Oldenburg

Year

2006

Author dc:creator

• Süß, Jacqueline

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