Konformationsanalyse von Zuckernucleotiden und Betrachtung ihrer Aktivität in der Galactosyltransferasereaktion

Im Mittelpunkt dieser Dissertation steht die Untersuchung der räumlichen Struktur von Zuckernucleotiden, die aktive Substrate in der Galactosyltransferasereaktion sind. Zunächst wurden verschiedene Bereiche der Molekülstruktur quantenmechanisch untersucht, um zusätzliche Parameter für das AMBER-Kraftfeld zu erhalten. In den anschließenden moleküldynamischen Simulationen und NMR-Experimenten wurde ersichtlich, dass die Derivate (Hydrierung und Desoxygenierungen im Nucleosidteil) stärker gefaltet sind als das native Substrat. Des Weiteren gab eine statistische Analyse dieses konformativen Verhaltens der Zuckernucleotide mit QSAR-Methoden Hinweise auf einen Zusammenhang zwischen der Konformation und der Aktivität in der Galactosyltransferasereaktion. Enthalpieberechnungen der Enzymreaktion mit mehreren verschiedenen Substraten und einer nachfolgenden statistischen Betrachtung ließen erkennen, dass die Dissoziationsenthalpie der Produkte (Diphosphonucleotide) ebenfalls mit der Aktivität korreliert.

Level thesis:degree_level

thesis.doctoral

Grantor dc:publisher

Universität Oldenburg

Year

2002

Author dc:creator

• Willecke, Andreas

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