Προσδιορισμός δομής, διαμορφωτικές ιδιότητες και ανακάλυψη πιθανών στόχων του παραγώγου του κινναμωμικού οξέος NGI25

Η ταυτοποίηση και η διαμορφωτική ανάλυση του παραγώγου της κινναμωμικής N βενζυλο-N-(2-(κυκλοεξυλαμινο)-2-οξοαιθυλο) κινναμαμίδης (NGI25) πραγματοποιήθηκε μέσω φασματοσκοπίας πυρηνικού μαγνητικού συντονισμού (NMR), μοριακής δυναμικής (MD) και κβαντικής μηχανικής (QM), δηλαδή ημιεμπειρικούς υπολογισμούς και υπολογισμούς πυκνότητας λειτουργικής θεωρίας (DFT). Επιπλέον, εφαρμόστηκαν ομοπυρηνικά (COSY, NOESY) και ετεροπυρηνικά (HSQC, HMBC) πειράματα για τον προσδιορισμό των πρωτονίων και των ατόμων άνθρακα. Μετά την ταυτοποίηση της δομής, το NGI25 υποβλήθηκε σε υπολογιστικές μελέτες για να αποκαλυφθούν οι πιο ευνοϊκές διαμορφώσεις του. Συγκεκριμένα, πραγματοποιήθηκαν μελέτες MD σε δύο διαφορετικούς διαλύτες, DMSO μέσης πολικότητας και τον υδρόφοβο διαλύτη του χλωροφορμίου .Τα αποτελέσματα που προέκυψαν υποδηλώνουν ότι το μόριο NGI25 υιοθετεί παρόμοιες διαμορφώσεις και στα δύο περιβάλλοντα. Συγκεκριμένα, οι δύο αρωματικοί δακτύλιοι του μορίου βρίσκονται σε χωρική γειτνίαση, ενώ παραμένουν αρκετά απομακρυσμένοι από το κυκλοεξάνιο. Τα πειράματα 2D NOESY επιβεβαίωσαν τους υπολογισμούς in silico MD και QM. Τέλος, πραγματοποιήθηκαν υπολογισμοί μοριακής πρόσδεσης προκειμένου να αποκαλυφθούν πιθανοί ενζυμικοί στόχοι για το NGI25. Χρησιμοποιήθηκε η πλατφόρμα Swiss target για να καθοδηγήσει την ανακάλυψη νέων στόχων με βάση τη δομή του NGI. Πράγματι, προβλέφθηκε ότι το NGI25 αναστέλλει τη βουτυρυλοχολινεστεράση (BCHE) και τη λιποξυγονάση (LOX). Πειράματα μοριακής πρόσδεσης, ακολουθούμενα από μελέτες μοριακής δυναμικής, επιβεβαίωσαν την ευνοϊκή σύνδεση του NGI25 και με τα δύο ένζυμα.

Authors dc:creator

• Σκουφάς Γεώργιος
• Skoufas Georgios

• Θετικές Επιστήμες
• Science

Language dc:language

Ελληνικά, Greek

Identifier

uoadl:5359787

OAI identifier oai:identifier

oai:lib.uoa.gr:uoadl:5359787