Strategien zur HLA-Typisierung mit PyrosequencingTM

Der Haupthistokompatibilitätskomplex ist durch seine biologische Funktion eine für die Diagnostik und Forschung äußerst wichtige Region im humanen Genom. Die Untersuchung von HLA-Genorten stellt ein wichtiges Instrument in der molekulargenetischen Praxis dar. Die Pyrosequencing-Technik ist gut geeignet, um kurze DNA-Abschnitte mit weitgehend bekannter Sequenz schnell und effizient zu untersuchen. Ziel dieser Arbeit war die Entwicklung von Pyrosequencing-basierten Methoden zur HLA-Typisierung. Exemplarisch wurden für drei wichtige HLA-Genorte, HLA-DQB1, HLA-DRB1 und HLA-B Untersuchungsstrategien entwickelt. Die Vorgehensweise wurde jeweils auf die Besonderheiten der unterschiedlichen Genorte angepasst. Die Strategien wurden an Standardproben validiert und in Kleinstudien angewendet. So wurde eine Fall-Kontroll-Studie zur Untersuchung einer möglichen Assoziation zwischen HLA-DRB1 und Alopecia areata mit Hilfe der entwickelten Typisierungsstrategie durchgeführt. Neben einer populationsgenetischen Untersuchung des HLA-B Genortes an Proben von Individuen aus Papua Neuguinea wurde die Pyrosequencing-Methode dafür eingesetzt, die Alleltrennung durch Haplotyp-spezifische Extraktion schnell und günstig zu überprüfen. Die Pyrosequencing Protokolle bieten eine sehr effiziente Alternative und Ergänzung zu den bestehenden HLA-Typisierungsmethoden.

Author dc:creator

• Entz, Patricia

Advisor dc:contributor.advisor

• Stahl, Ulf

Licence dc:rights.uri

• http://rightsstatements.org/vocab/InC/1.0/

Language dc:language.iso

de, German

Identifier URI

urn:nbn:de:kobv:83-opus-13741
http://dx.doi.org/10.14279/depositonce-1425

OAI identifier oai:identifier

oai:depositonce.tu-berlin.de:11303/1722