Nucleic acid amplification from crude clinical samples exemplified by Chlamydia trachomatis detection in urine

Seksuaalsel teel levivad infektsioonid (STLI) on oluliseks koormaks tervishoiusüsteemile. Iga päev nakatub nendesse üle miljoni inimese maailmas. Ainuüksi Chlamydia trachomatise uute juhtumite arv ulatub 130 miljonini aastas. STLI-de diagnoosimine on keeruline, sest enamus nendest ei põhjusta sümptomeid. Samas ravimata jäänud suguhaigused võivad viia krooniliste põletikkeni ning avaldada selle kaudu olulist mõju inimese reproduktiivsele tervisele. Kõrgesse riskigruppi kuuluvate inimeste testimine on ennast tõestanud efektiivne strateegia STLI-de leviku piiramiseks ning nendega seonduvate tüsistuste vältimiseks. Profülaktiline STLI diagnostika vajab aga usaldusväärseid ja kiireid lahendusi, mille puudumist peetakse peamiseks STLI-de laialdase leviku põhjuseks. Tsentraalsetesse laboritesse koondunud nukleiinhapete amplifikatsioonil põhinevad meetodid pakkuvad väga täpseid diagnostika tulemusi. Nende miinuseks on aga kõrge hind, infrastruktuuri vajadus ja pikk ooteaeg tulemuseni. Alternatiivina on kasutusele võetud mitmed ühekordsed kiirtestid, mis enamasti võimaldavad diagnoosida haigustekitaja olemasolu poole tunniga ning ei vaja spetsiifilist aparatuuri. Praegu turul olevad immunoanalüüsil põhinevad C. trachomatise kiirtestid ei suuda aga pakkuda vajalikku diagnostilist täpsust. Suur valenegatiivsete vastuste arv piirab nende laialdast rakendamist. Käesolevas töös uuritakse võimalusi nukleiinhapete amplifikatsiooni rakendamiseks ühekordselt kasutatavates diagnostika kiirtestides. Töös näidatakse, et isotermilise amplifikatsiooni kasutamine võimaldab asendada nukleiinhapete puhastamise etappi lihtsa proovi eeltöötlusega, võimaldades seega amplifikatsiooni otse kliinilistest proovidest. Uus metoodika on lihtne, sobib instrumendi-vabaks rakendamiseks ning võimaldab saada diagnostilist vastust poole tunni jooksul. Lisaks näitas kliiniline uuring, et selle diagnostiline täpsus on oluliselt suurem C. trachomatise immunoloogilistest kiirtestidest.

Author

• Krõlov, Katrin

• chlamydia trachomatis
• diagnostika (med.)
• uriinianalüüs
• nukleiinhapped
• diagnostics
• urine analysis
• nucleic acids

Identifier

hdl:10062/58794

OAI identifier oai:identifier

oai:dspace.ut.ee:10062/58794