Abstract
Semliki Forest viirus kuulub alfaviiruste perekonda sugukonnas Togaviridae. Alfaviirused on olulised patogeenid ning põhjustavad erinevaid vaevusi nii loomadele kui ka inimestele. Levik looduses toimub sääskede vahendusel. Lisaks tähtsusele patogeensuse tõttu on alfaviirused kasutusel ka bio- ning geenitehnoloogias. Alfaviirustel on positiivse polaarsusega RNA genoom, millelt transleeritakse viiruse replikaasi subühikud (nsP1-nsP4). Antud töö põhiline uurimisobjekt nsP1 vastutab lisaks osalemisele replikatsioonil ja transkriptsioonil replikaasi sidumise eest peremeesraku membraanidele. Antud töö tulemusena tuvastati, et nsP1 palmitüleerimine membraaniga seondumise tugevdamiseks ei ole viirusele hädavajalik. Palmitüleerimine hõlbustab kontaktide loomist nsP1 ja viiruse polümeraasi (nsP4) vahel imetaja rakkudes. Palmitüleerimise puudumisel omandab viirus sekundaarsed mutatsioonid, mis taastavad vastavate kontaktide moodustamise võimet imetajarakkudes. Samad mutatsioonid viiruse elulemust putuka rakkudes olulisel määral ei mõjuta. Leiti, et mittestruktuurse polüproteiini lõikamine nsP1 ja nsP2 vahelt on üks funktsionaalse replikaaskompleksi moodustumise kontrollpunktidest. 1/2 saidi lõikamise kiirendamine vähendab olulisel määral viiruse infektsioonilisust; lõikamise aeglustamisel on väiksem mõju. Mutatsioonanalüüs näitas, et 1/2 saidi lõikust mõjutab eelkõige üks nsP1 valgus lõpus asuv aminohappejääk (P5). Täiendav mutatsioon nsP2 kodeerivas piirkonnas (Q706R) taastas mutantse lõikesaidiga viiruse elujõulisuse ja liitvalgu korrektse lõikamise imetaja rakkudes, ent selline viirus ei suutnud edukalt paljuneda putuka rakkudes ning terviklikku interferoonvastust omavates imetaja rakkudes. Nendest tulemustes lähtuvalt pakuti välja hüpotees, mille kohaselt mutatsioonid 1/2 lõikesaidis ja nsP2 valgus põhjustavad viiruse P123 liitvalgu eluea pikenemise, mis takistab viiruse võimet blokeerida natiivse immuunvastuse teket. Uuritud mutatsioonide bioloogiliste efektide põhjalikumaks uurimiseks on tarvis läbi viia loomkatseid.
Author and committee
dc:creator, dc:contributor.*- Author
-
- Karo-Astover, Liis
Subjects
dc:subject × 10Identifiers
dc:identifier.*- Identifier
- hdl:10062/33186
- OAI identifier oai:identifier
- oai:dspace.ut.ee:10062/33186