Caractérisation des systèmes d'exclusion des plasmides conjugatifs IncC
La dissémination de résistance à de multiples antibiotiques est un enjeu majeur de santé publique. Ce phénomène est notamment dû à la conjugaison bactérienne, qui permet la transmission d’ADN entre deux bactéries présentes dans le même milieu, même entre espèces qui peuvent être phylogénétiquement très différentes. Les plasmides IncC sont des plasmides conjugatifs qui peuvent conférer une résistance à de multiples antibiotiques à leurs hôtes bactéries. Ils sont également capables de mobiliser des îlots génomiques lors de leur dissémination, tel que le Salmonella genomic island 1 (SGI1). Ces îlots participent eux aussi à la dissémination de gènes de résistance aux antibiotiques. L’objet de ce mémoire est de caractériser les systèmes d’exclusion des plasmides IncC, des mécanismes qui empêchent l’entrée d’un plasmide IncC dans une bactérie qui contient déjà un de ces plasmides. Pour cette caractérisation, une approche génétique a été privilégiée, consistant à observer l’effet de délétions de gènes sur l’efficacité de transferts de ces plasmides. Cette approche a été étayée par des analyses phylogénétiques, des prédictions de structures protéiques et une mutagénèse par insertion de transposon. Les résultats décrits dans ce mémoire montrent l’existence de deux systèmes d’exclusion chez les plasmides IncC et les plasmides apparentés : un système d’exclusion d’entrée, impliquant EexC chez la cellule réceptrice et TraG chez la cellule donneuse ; et un système d’exclusion de surface, médié par SfxC chez la cellule réceptrice. Le système d’exclusion d’entrée peut être contourné par SGI1 lors de sa mobilisation, ce qui permet à cet îlot de se disséminer dans des populations bactériennes contenant un plasmide IncC. J’ai aussi montré que SGI1 exerce lui aussi une exclusion d’entrée : il s’agit du premier système d’exclusion d’entrée connu encodé par un îlot génomique mobilisable.
T4SS, SGI1, Conjugaison bactérienne, Plasmides IncC, Exclusion d’entrée, Exclusion de surface
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