Identificación y caracterización de elementos regulatorios distales controlados por TGFβ
type: CreativeWork
description: En este trabajo se ha realizado un análisis exhaustivo de los enhancers en células normales de epitelio de glándula mamaria de ratón (NMuMG) para entender, de forma más detallada, cómo los enhancers dependientes de TGFβ controlan la transcripción génica en células epiteliales. El tratamiento con TGFβ desencadena un incremento rápido y generalizado de la accesibilidad de la cromatina en el 80% de los enhancers, independientemente de si van a ser activados, reprimidos o no regulados por TGFβ. Esta apertura de los enhancers depende tanto de la ruta canónica como no canónica de la señalización por TGFβ. Los análisis de footprinting genómico sugieren que los factores de transcripción de la familia AP-1 y SMAD desempeñan un papel principal en este proceso. Por otro lado, la mayoría de los genes regulados por TGFβ se localizan alrededor de los enhancers regulados en el mismo sentido, creando a menudo dominios de varios genes corregulados que denominamos dominios regulatorios de TGFβ o TRDs (por sus siglas en inglés). La inactivación de enhancers dentro de TRDs mediada por CRISPR afectó a la regulación dependiente de TGFβ de todos los genes corregulados, demostrando que la actividad de los enhancers es mucho más promiscua que lo previamente anticipado. En particular, el área de influencia de los TRDs está restringida por los bordes de TADs, causando un sesgo hacia la corregulación dentro de los TADs. To better understand how TGFβ-dependent enhancers control gene transcription in epithelial cells, we performed a comprehensive analysis of enhancers in normal mammary epithelial gland (NMuMG) cells. TGFβ treatment triggers a fast and widespread increase in chromatin accessibility in about 80% of enhancers, irrespective of whether they are activated, repressed or not regulated by TGFβ. This enhancer opening depends on both the canonical and non-canonical TGFβ pathways. Genomic footprinting analyses suggest that the SMAD and AP-1 transcription factors are important players in thi…
abstract: En este trabajo se ha realizado un análisis exhaustivo de los enhancers en células normales de epitelio de glándula mamaria de ratón (NMuMG) para entender, de forma más detallada, cómo los enhancers dependientes de TGFβ controlan la transcripción génica en células epiteliales. El tratamiento con TGFβ desencadena un incremento rápido y generalizado de la accesibilidad de la cromatina en el 80% de los enhancers, independientemente de si van a ser activados, reprimidos o no regulados por TGFβ. Esta apertura de los enhancers depende tanto de la ruta canónica como no canónica de la señalización por TGFβ. Los análisis de footprinting genómico sugieren que los factores de transcripción de la familia AP-1 y SMAD desempeñan un papel principal en este proceso. Por otro lado, la mayoría de los genes regulados por TGFβ se localizan alrededor de los enhancers regulados en el mismo sentido, creando a menudo dominios de varios genes corregulados que denominamos dominios regulatorios de TGFβ o TRDs (por sus siglas en inglés). La inactivación de enhancers dentro de TRDs mediada por CRISPR afectó a la regulación dependiente de TGFβ de todos los genes corregulados, demostrando que la actividad de los enhancers es mucho más promiscua que lo previamente anticipado. En particular, el área de influencia de los TRDs está restringida por los bordes de TADs, causando un sesgo hacia la corregulación dentro de los TADs. To better understand how TGFβ-dependent enhancers control gene transcription in epithelial cells, we performed a comprehensive analysis of enhancers in normal mammary epithelial gland (NMuMG) cells. TGFβ treatment triggers a fast and widespread increase in chromatin accessibility in about 80% of enhancers, irrespective of whether they are activated, repressed or not regulated by TGFβ. This enhancer opening depends on both the canonical and non-canonical TGFβ pathways. Genomic footprinting analyses suggest that the SMAD and AP-1 transcription factors are important players in thi…
author: Guerrero Martínez, José A.
language: spa
license: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
date published: 2021-03-02
date modified: 2026-07-24T04:29:17Z
provider: Universidad de Sevilla
publisher: Networked Digital Library of Theses and Dissertations
type: WebPage
source organization: Universidad de Sevilla

PropertyValue
property ID: Handle
value: https://hdl.handle.net/11441/110285