Identification de marqueurs de stress chez le crabe des neiges (Chionoecetes opilio) par une approche de transcriptomique et de métabolomique

L’industrie du crabe des neiges (Chionoecetes opilio) génère annuellement des retombées de plusieurs millions de dollars au Canada et au Nouveau-Brunswick. À l’heure actuelle, il n’existe aucun système qui permet de garder le crabe vivant une fois pêché. Il doit donc être cuit et congelé, ce qui engendre une pression considérable sur les usines. Une des raisons qui explique la difficulté à garder le crabe vivant une fois pêché est l’état des crabes au débarquement. En effet, au débarquement les crabes sont grandement affaiblis par le stress extrême causé par la pêche et le transport. Pour optimiser le transport du crabe vivant, il faudrait des marqueurs qui permettraient de mesurer les niveaux de stress chez le crabe des neiges. Pour le moment, la disponibilité de marqueurs de stress chez les crustacés est limitée, et aucun ne permet de prédire la mortalité efficacement chez le crabe des neiges. Mon projet avait comme objectif d’utiliser une approche non ciblée de transcriptomique et de métabolomique pour identifier des pistes pour le développement de marqueurs de stress chez le crabe des neiges. Pour y arriver, nous avons exposé les crabes à des conditions similaires à celles retrouvées lors de transport. Nous avons ensuite échantillonné l’hépatopancréas que nous avons utilisé pour extraire l’ARN qui a été envoyé pour la préparation des libraires puis du séquençage. Des échantillons d’hépatopancréas ont également été analysés en métabolomique pour quantifier les métabolites affectés. Tel qu’attendu, les protéines de choc thermique et les hormones hyperglycémiques des crustacés étaient surexprimées. Parmi les pistes les plus prometteuses, nous avons déterminé que la tyrosine décarboxylase était significativement sur-exprimée chez les crabes stressés, ce qui suggère une implication de la tyramine et de l’octopamine en tant que médiateurs de la réponse au stress. Nous avons également détecté une accumulation variable de lactate chez les crabes stressés. Nous suggérons que les crabes avec les niveaux de lactate les plus bas sont les meilleurs candidats pour la mise en place de systèmes capables de garder les crabes vivants une fois pêchés. Des études futures devront valider ces métabolites comme marqueurs de stress. Mots clefs : Crabe des neiges, marqueurs de stress, stress, transcriptomique, métabolomique, émersion, tyrosine décarboxylase, lactate.

Name thesis:degree_name

Maîtrise ès sciences (biologie)

Level thesis:degree_level

2e cycle

Discipline thesis:degree_discipline

Faculté des études supérieures et de la recherche

Grantor dc:publisher

Université de Moncton

Year dc:date.issued

2023

Author dc:creator

• Power, Claude

Advisors dc:contributor.advisor

• Dion-Côté, Anne-Marie
• Lamarre, Simon

Statement dc:rights

• Author

Language dc:language.iso

iso639-2b, fre

Dc Identifier Other

umir:3346

OAI identifier oai:identifier

oai:umoncton.scholaris.ca:20.500.14658/8019