Suivi du crabe vert (Carcinus maenas) par détection de l'ADN environnemental: validation de l'approche et détection dans la région de Miramichi au Nouveau-Brunswick
Les espèces aquatiques envahissantes peuvent être retrouvés à la grandeur du globe. Après s’être installées dans un nouvel environnement, ces espèces peuvent engendrer des impacts environnementaux et économiques. Pour détecter et surveiller ces espèces, des méthodes traditionnelles de suivi comme le trappage et la pêche sont utilisées, mais ne sont pas toujours efficaces et peuvent être longues. Notre objectif de recherche était de déterminer si la rivière Miramichi constituait une barrière écologique contre l’avancée du crabe vert (Carcinus maenas) vers le Nouveau-Brunswick (N-B). En effet, la littérature documente une barrière potentielle à l’embouchure du sud de la rivière, où un tourbillon marin a été observé, ce qui représenterait un obstacle pour la dispersion larvaire de l’espèce. Pour ce faire, nous avons utilisé une approche novatrice de détection de l’ADN environnemental (ADNe) de l’espèce à partir d’échantillons d’eau. Nous avons d’abord validé notre approche spécifique à l’espèce à l’aide d’échantillons d’eau récoltés à Shédiac à des sites ayant un fort historique de présence du crabe vert. Nous avons ensuite récolté des échantillons d’eau le long de la côte nord et sud de la rivière Miramichi afin d’évaluer la distribution de l’espèce de façon hebdomadaire durant un mois. À chaque récolte, des variables environnementales comme la température de l’eau, la salinité, l’oxygène dissous et la turbidité ont été mesurées. Tous les échantillons d’eau ont été filtrés dans un délai de 24h et l’ADNe contenu dans les filtres a été extrait. L’ADNe a ensuite été utilisé dans des tests de réaction de polymérase en chaine quantitative (qPCR) pour signaler la détection ou non de l’espèce. Avec les données de présence du crabe vert, nous avons exploré s’il y avait des associations possibles entre les variables environnementales et la présence du crabe vert parmi les différents sites d’échantillonnage. Nos résultats ont révélé que notre approche est efficace pour détecter l’ADN du crabe vert dans un échantillon d’eau. Cependant, aucune détection n’a été signalée aux sites le long de la rivière Miramichi. Il a été impossible de faire des associations compte tenu de l’absence de détection et de la grande variabilité des variables mesurées. Ainsi, il est encore incertain si la rivière Miramichi représente une barrière écologique pour l’avancée du crabe vert. Cette étude est l’une des rares ayant tenté de détecter l’ADNe d’un crustacé. Elle détaille les démarches à suivre pour appliquer cette approche et documente aussi les méthodes à suivre pour améliorer la concentration en ADNe pour un crustacé, ainsi que les variables à considérer en milieu côtier.
Crabe enragé, ADN environnemental, Organismes aquatiques introduits, Sciences aquatiques, Écologie
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