Caractérisation génétique et biocontrôle des STREPTOMYCES SPP. causant la gale commune de la pomme de terre dans les maritimes

La gale commune de la pomme de terre, une maladie d'importance économique pour le Canada, est causée par Streptomyces scabies et autres espèces apparentées. Le développement de lésions nécrotiques à la surface des tubercules de ce légume résulte d'une production de thaxtomines par l'agent pathogène. La protéine Nec1 contribue à la virulence de l'agent pathogène en assurant la colonisation maximale du site d'infection. Il a également été proposé que la tomatinase TomA soit impliquée au niveau de la virulence, bien que son rôle demeure inconnu. Présentement, aucune stratégie de contrôle n'est suffisamment adéquate pour protéger la pomme de terre contre cette maladie. La première étape à l'élaboration d'une stratégie efficace de biocontrôle consiste en une caractérisation de la diversité de l'agent pathogène. Ainsi, la diversité génétique et la distribution des Streptomyces spp. causant la gale commune de la pomme de terre dans les provinces des Maritimes (Canada) ont été évaluées à l'aide (i) d'amplifications par réactions de polymérase en chaîne (PCRs) d'éléments répétitifs d'ADN et (ii) d'analyses phylogénétiques de gènes d'intérêt taxonomique et de gènes de pathogénicité et/ou de virulence. Les Streptomyces spp. pathogènes ont été classés en dix groupes génétiques, dont huit retrouvés chacun dans une seule province, suggérant une distribution géographique spécifique. Les espèces pathogènes dominantes causant la gale commune dans ces régions sont hautement apparentées à S. scabies. Streptomyces acidiscabies a également été détecté au Nouveau-Brunswick. Les gènes de biosynthèse des thaxtomines (txtA et txtC) et le gène tomA ont été retrouvés dans le génome de chaque isolat. Contrairement au gène tomA, les séquences des gènes txtA et txtC ont chacune présenté un site polymorphique. La caractérisation des interactions entre un agent pathogène et un agent de biocontrôle est également essentielle à l'implémentation réussie d'une approche de contrôle d'une maladie. Ainsi, la capacité de souches de Pseudomonas spp. (LBUM 223, LBUM 300 et LBUM 647), productrices de composés antimicrobiens, à inhiber la croissance de S. scabies et à réprimer la transcription de gènes de pathogénicité et/ou de virulence chez l'agent pathogène a été évaluée à l'aide d'expériences de confrontation in vitro et de PCRs quantitatives couplées à la transcription inverse. Des organismes évalués, seul LBUM 223 a été en mesure d'inhiber la croissance de S. scabies et de réprimer l'expression des gènes txtA, txtC, nec1 et tomA chez l'agent pathogène. LBUM 223 produit de l'acide phénazine-l-carboxylique (PCA), un antibiotique participant au biocontrôle de maladies. Le rôle du PCA dans l'inhibition de la croissance de S. scabies, la répression de l'expression de gènes de biosynthèse des thaxtomines et le contrôle de la gale commune de la pomme de terre par LBUM 223 a été évalué. À cette fin, la capacité à produire du PCA a été compromise chez LBUM 223. La mutation de phzC (gène de biosynthèse des dérivés de phénazine) chez LBUM 223 a résulté en une perte de la capacité à produire le PCA. Une diminution de la capacité à inhiber la croissance de l'agent pathogène, une inhabileté à réprimer la transcription des gènes txtA et txtC et une incapacité à contrôler la gale commune de ta pomme de terre en ont découlé, suggérant que la production de PCA est essentielle aux capacités de biocontrôle exprimées par LBUM 223. Une caractérisation de la diversité des agents causaux de la gale commune de la pomme de terre dans les provinces des Maritimes ainsi que des interactions en jeu entre ces agents pathogènes et un agent de biocontrôle prometteur, dont LBUM 223, constitue une étape importante à l'élaboration d'une stratégie de biocontrôle de la gale commune de la pomme de terre durable pour la région.

Name thesis:degree_name

Maîtrise ès sciences (biologie)

Level thesis:degree_level

2e cycle

Discipline thesis:degree_discipline

Faculté des sciences

Grantor dc:publisher

Université de Moncton

Year dc:date.issued

2010

Author dc:creator

• St-Onge, Renée J.

Advisors dc:contributor.advisor

• Filion, Martin
• Goyer, Claudia

• Gale commune de la pomme de terre
• Streptomyces scabies
• Pseudomonas
• Variabilité génétique
• Antibiose

Statement dc:rights

• Author

Language dc:language.iso

iso639-2b, fre

Identifier

oclc: 769769704

Dc Identifier Other

umir:1553

OAI identifier oai:identifier

oai:umoncton.scholaris.ca:20.500.14658/6561