Modifizierte Peptidnucleinsäuren für die sequenzselektive DNA-Spaltung und DNA-Nachweis

Es wurden Metallkomplex-Konjugate von Peptidnucleinsäuren (PNAs) synthetisiert und in zwei Projekten angewendet: als “künstliche Restriktionsenzyme“ für die sequenzselektive Spaltung von Einzelstrang-DNA sowie als Komponenten einer DNA-templatvermittelten Metallkatalyse. Im ersten Projekt konnte durch MALDI-TOF MS und HPLC der Zr(IV)-Komplex des Tris(hydroxymethyl)-aminomethan-PNA-Konjugats (Zr(IV)-15) als aktivste Spezies zur Spaltung komplementärer DNA identifiziert werden. Die Spaltung der Ziel-DNA erfolgte sequenzselektiv zu 91% (nach 164 Stunden) in unmittelbarer Nachbarschaft des Metallkomplexes. Konjugate einer Cu(II)-Pyridylpyrazol-modifizierten PNA (Cu(II)-31) wurden für die DNA-templatvermittelte Spaltung estermodifizierter PNAs eingesetzt. Als Substrat-PNAs wurden die PNA-Ester-Konjugate 16 und 17 synthetisiert, in denen die Cu(II)-Ankergruppe (Chinolin-N) in die Alkohol-PNA-Komponente integriert ist. Es kann im Grunde mit beliebigen Carbonsäuren kombiniert werden. Die Spaltreaktionen wurden durch eine Kombination aus MALDI-TOF MS- und HPLC-Analyse untersucht. Es konnte gezeigt werden, dass die Reaktion durch das DNA-Templat etwa 100-fach beschleunigt wird. Des weiteren wurden nach 10 Stunden 12 Turnover bei einem 100-fachen Substratüberschuss erzielt.

Level thesis:degree_level

thesis.doctoral

Grantor dc:publisher

Universität Heidelberg

Year

2003

Author dc:creator

• Zelder, Felix Hubertus

Contributors dc:contributor

• Krämer, Roland

Repository record source_url

http://www.ub.uni-heidelberg.de/archiv/4348

OAI identifier oai:identifier

oai:archiv.ub.uni-heidelberg.de:4348