Untersuchung von Membran-DNA Komplexen in äußeren elektrischen Feldern
Untersuchung von Membran-DNA Komplexen in äußeren elektrischen Feldern Die vorliegende Arbeit beschreibt die Entwicklung, Optimierung und Automatisierung einer neuartigen Methode zum Transferieren von DNA-Molekülen in Polyacrylamidgele. Zuerst wird die DNA-Lösung durch Kapillarkräfte in geeignete poröse Membranen absorbiert. Danach wird ein äußeres elektrisches Feld angelegt. Die Bindungskräfte zwischen der Membran und der DNA überlagern sich mit der elektrischen Feldkraft derart, dass eine resultierende Kraft auf die DNA-Moleküle in Richtung des Gels wirkt. Die praktischen Arbeiten wurden auf der am EMBL entwickelten automatischen DNA-Sequenziereinheit Arakis durchgeführt. Über die automatische Detektion und Analyse der DNA-Fragmente hinaus konnte mit dieser Methode das Auftragen der Proben vollständig automatisiert werden. Membrangebundene Proben trugen dazu bei den Durchsatz auf Arakis, bei gleichbleibender Qualität der Sequenzdaten, um mehr als den Faktor 4 zu erhöhen. Die Methode wurde erfolgreich auf das Sequenziersystem ABI PRISM 377 der Firma 'Applied Biosystems' übertragen. Zur Kommerzialisierung wurde eine Lizenz an die Firma 'MWG-Biotech' vergeben.
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