{"id":{"repo_id":"goettingen","oai_identifier":"oai:ediss.uni-goettingen.de:11858/00-1735-0000-0006-ABA3-C"},"canonical_url":"https://search.dev.ndltd.org/etd/goettingen/oai:ediss.uni-goettingen.de:11858/00-1735-0000-0006-ABA3-C","repository":{"repo_id":"goettingen","name":"Georg-August-Universität Göttingen","base_url":"https://ediss.uni-goettingen.de/oai/request"},"display":{"title":"Etablierung und Anwendung der Chromatin-Immunopräzipitation für <i>in vivo</i>-Bindungsstudien der bZIP-Transkriptionsfaktoren TGA2.1 und TGA2.2 an Promotoren der Pathogenabwehr in Tabak","abstract":"Das as-1-Element, welches ursprünglich aus dem Blumenkohl-Mosaik-Virus isoliert wurde, ist induzierbar durch Salizylsäure (SA), Auxin und Pathogenbefall. Elemente, die dem as-1-Element ähnlich sind, wurden in Promotoren vieler Pathogenabwehr-Gene gefunden. Zu ihnen zählen z.B. das früh exprimierte Gen Nt103 eine Glutathion-S-Transferase oder das spät exprimierte Gen PR1a. DNA-Bindestudien (EMSA) zeigten, dass das as-1-Element von den bZIP-Transkriptionsfaktoren TGA2.1 und TGA2.2 erkannt wird. Um eine in vivo-Interaktion der TGA-Faktoren mit endogenen as-1-ähnlichen Promotorelementen zu untersuchen, wurde die Chromatin-Immunopräzipitation (ChIP) für Tabak entwickelt. Die Etablierung erfolgte über die Verwendung eines Tetrazyclin-induzierbaren Promotorsystems, bei welchem zwei unterschiedliche Bindungszustände eines artifiziellen Transkriptionsfaktors untersucht werden konnten. ChIP-Experimente mit Pflanzen, die das Reportergenkonstrukt as-1::GUS tragen, zeigten eine konstitutive Bindung des TGA2.2 am as-1-Element nach Salizylsäure-Stimulus, während für PR1a eine induzierbare Bindung nachgewiesen werden konnte.","abstract_html":"Das as-1-Element, welches ursprünglich aus dem Blumenkohl-Mosaik-Virus isoliert wurde, ist induzierbar durch Salizylsäure (SA), Auxin und Pathogenbefall. Elemente, die dem as-1-Element ähnlich sind, wurden in Promotoren vieler Pathogenabwehr-Gene gefunden. Zu ihnen zählen z.B. das früh exprimierte Gen Nt103 eine Glutathion-S-Transferase oder das spät exprimierte Gen PR1a. DNA-Bindestudien (EMSA) zeigten, dass das as-1-Element von den bZIP-Transkriptionsfaktoren TGA2.1 und TGA2.2 erkannt wird. Um eine in vivo-Interaktion der TGA-Faktoren mit endogenen as-1-ähnlichen Promotorelementen zu untersuchen, wurde die Chromatin-Immunopräzipitation (ChIP) für Tabak entwickelt. Die Etablierung erfolgte über die Verwendung eines Tetrazyclin-induzierbaren Promotorsystems, bei welchem zwei unterschiedliche Bindungszustände eines artifiziellen Transkriptionsfaktors untersucht werden konnten. ChIP-Experimente mit Pflanzen, die das Reportergenkonstrukt as-1::GUS tragen, zeigten eine konstitutive Bindung des TGA2.2 am as-1-Element nach Salizylsäure-Stimulus, während für PR1a eine induzierbare Bindung nachgewiesen werden konnte.","abstract_has_math":false,"creators":["Butterbrodt, Thomas Walter"],"institution":null,"degree_name":null,"degree_level":null,"degree_discipline":null,"degree_department":null,"school":null,"contributors":["Gatz, Christiane Prof. Dr.","Lohaus, Gertrud PD Dr."],"advisors":[],"committee_chairs":[],"committee_members":[],"year":2012,"date_issued":"2012-04-16T14:56:27Z","date_published":"2012-04-16T14:56:27Z","updated_at":"2026-07-24T02:24:11Z","subjects":["570 Biowissenschaften, Biologie","Biologie","Chromatin-Immunopräzipitation","ChIP","Tabak","Pathogenabwehr","chromatin-immunoprecipitation","tobacco","pathogen defense","42.13","WF200"],"languages":["ger"],"rights":[],"rights_urls":["https://webdoc.sub.gwdg.de/diss/copyr_diss.html"],"identifier_entries":[{"key":"dc:identifier","label":"Identifier","values":["https://dx.doi.org/10.53846/goediss-610","urn:nbn:de:gbv:7-webdoc-605-6","webdoc-605","509218199"],"render_values":[{"text":"https://dx.doi.org/10.53846/goediss-610","href":"https://dx.doi.org/10.53846/goediss-610","code":true},{"text":"urn:nbn:de:gbv:7-webdoc-605-6","href":null,"code":true},{"text":"webdoc-605","href":null,"code":true},{"text":"509218199","href":null,"code":true}]}]},"links":{"outbound_url":"https://hdl.handle.net/11858/00-1735-0000-0006-ABA3-C","outbound_label":"Handle","outbound_source":"dc:identifier"},"metadata_groups":[{"id":"people","label":"People","entries":[{"key":"dc:contributor","label":"Contributor","values":["Gatz, Christiane Prof. Dr.","Lohaus, Gertrud PD Dr."]},{"key":"dc:creator","label":"Author","values":["Butterbrodt, Thomas Walter"]}]},{"id":"academic_context","label":"Academic Context","entries":[{"key":"dc:date","label":"Dc Date","values":["2012-04-16T14:56:27Z","2013-01-30T23:50:40Z","2005-11-25","2005-11-03"]},{"key":"dc:type","label":"Dc Type","values":["doctoralThesis"]}]},{"id":"subjects_keywords","label":"Subjects and Keywords","entries":[{"key":"dc:subject","label":"Dc Subject","values":["570 Biowissenschaften, Biologie","Biologie","Chromatin-Immunopräzipitation","ChIP","Tabak","Pathogenabwehr","chromatin-immunoprecipitation","tobacco","pathogen defense","42.13","WF200"]}]},{"id":"language_rights","label":"Language and Rights","entries":[{"key":"dc:language","label":"Dc Language","values":["ger"]},{"key":"dc:rights","label":"Dc Rights","values":["https://webdoc.sub.gwdg.de/diss/copyr_diss.html"]}]},{"id":"identifiers","label":"Identifiers","entries":[{"key":"dc:identifier","label":"Identifier","values":["https://hdl.handle.net/11858/00-1735-0000-0006-ABA3-C","https://dx.doi.org/10.53846/goediss-610","urn:nbn:de:gbv:7-webdoc-605-6","webdoc-605","509218199"]}]},{"id":"additional","label":"Additional Metadata","entries":[{"key":"dc:description","label":"Description","values":["Das as-1-Element, welches ursprünglich aus dem Blumenkohl-Mosaik-Virus isoliert wurde, ist induzierbar durch Salizylsäure (SA), Auxin und Pathogenbefall. Elemente, die dem as-1-Element ähnlich sind, wurden in Promotoren vieler Pathogenabwehr-Gene gefunden. Zu ihnen zählen z.B. das früh exprimierte Gen Nt103 eine Glutathion-S-Transferase oder das spät exprimierte Gen PR1a. DNA-Bindestudien (EMSA) zeigten, dass das as-1-Element von den bZIP-Transkriptionsfaktoren TGA2.1 und TGA2.2 erkannt wird. Um eine in vivo-Interaktion der TGA-Faktoren mit endogenen as-1-ähnlichen Promotorelementen zu untersuchen, wurde die Chromatin-Immunopräzipitation (ChIP) für Tabak entwickelt. Die Etablierung erfolgte über die Verwendung eines Tetrazyclin-induzierbaren Promotorsystems, bei welchem zwei unterschiedliche Bindungszustände eines artifiziellen Transkriptionsfaktors untersucht werden konnten. ChIP-Experimente mit Pflanzen, die das Reportergenkonstrukt as-1::GUS tragen, zeigten eine konstitutive Bindung des TGA2.2 am as-1-Element nach Salizylsäure-Stimulus, während für PR1a eine induzierbare Bindung nachgewiesen werden konnte.","The as-1 element, originally found in the Cauliflower Mosaic virus, is inducible by salycylic acid, auxin and also by pathogen attack. Several as-1-like elements were also found in plant promoters of pathogen defense genes like the early response gene Nt103 (a glutathione-S-transferase) or the late responsive pathogenesis related protein PR1a. Binding studies using EMSA revealed recognition of the as-1 element by the TGA factors TGA2.1 and TGA2.2, members of the bZIP transcription factor family. To investigate the in vivo interaction between the TGA factors and as-1 like promoter elements a chromatin immunoprecipitation assay (ChIP) for tobacco leaves was developed. Establishment of the technique was proofed using the tetracyclin-inducible expression system in tobacco plants were two different conditions were tested successfully. ChIP experiments with transgenic tobacco plants carrying the reporter construct as-1::GUS have shown a constitutive binding of TGA2.2 to the native as-1 element while binding to as-1-like promoter element from PR1a occurs to be inducible by SA treatment."]},{"key":"dc:format","label":"Dc Format","values":["application/pdf"]},{"key":"dc:title","label":"Title","values":["Etablierung und Anwendung der Chromatin-Immunopräzipitation für <i>in vivo</i>-Bindungsstudien der bZIP-Transkriptionsfaktoren TGA2.1 und TGA2.2 an Promotoren der Pathogenabwehr in Tabak","Establishment of the chromatin-immunoprecipitation for <i>in vivo</i>-binding studies of the bZIP transcription factors TGA2.1 and TGA2.2 at promotors of the pathogen defense response in tobacco"]}]}],"canonical_facts":{"dc:contributor":["Gatz, Christiane Prof. Dr.","Lohaus, Gertrud PD Dr."],"dc:creator":["Butterbrodt, Thomas Walter"],"dc:date":["2012-04-16T14:56:27Z","2013-01-30T23:50:40Z","2005-11-25","2005-11-03"],"dc:description":["Das as-1-Element, welches ursprünglich aus dem Blumenkohl-Mosaik-Virus isoliert wurde, ist induzierbar durch Salizylsäure (SA), Auxin und Pathogenbefall. Elemente, die dem as-1-Element ähnlich sind, wurden in Promotoren vieler Pathogenabwehr-Gene gefunden. Zu ihnen zählen z.B. das früh exprimierte Gen Nt103 eine Glutathion-S-Transferase oder das spät exprimierte Gen PR1a. DNA-Bindestudien (EMSA) zeigten, dass das as-1-Element von den bZIP-Transkriptionsfaktoren TGA2.1 und TGA2.2 erkannt wird. Um eine in vivo-Interaktion der TGA-Faktoren mit endogenen as-1-ähnlichen Promotorelementen zu untersuchen, wurde die Chromatin-Immunopräzipitation (ChIP) für Tabak entwickelt. Die Etablierung erfolgte über die Verwendung eines Tetrazyclin-induzierbaren Promotorsystems, bei welchem zwei unterschiedliche Bindungszustände eines artifiziellen Transkriptionsfaktors untersucht werden konnten. ChIP-Experimente mit Pflanzen, die das Reportergenkonstrukt as-1::GUS tragen, zeigten eine konstitutive Bindung des TGA2.2 am as-1-Element nach Salizylsäure-Stimulus, während für PR1a eine induzierbare Bindung nachgewiesen werden konnte.","The as-1 element, originally found in the Cauliflower Mosaic virus, is inducible by salycylic acid, auxin and also by pathogen attack. Several as-1-like elements were also found in plant promoters of pathogen defense genes like the early response gene Nt103 (a glutathione-S-transferase) or the late responsive pathogenesis related protein PR1a. Binding studies using EMSA revealed recognition of the as-1 element by the TGA factors TGA2.1 and TGA2.2, members of the bZIP transcription factor family. To investigate the in vivo interaction between the TGA factors and as-1 like promoter elements a chromatin immunoprecipitation assay (ChIP) for tobacco leaves was developed. Establishment of the technique was proofed using the tetracyclin-inducible expression system in tobacco plants were two different conditions were tested successfully. ChIP experiments with transgenic tobacco plants carrying the reporter construct as-1::GUS have shown a constitutive binding of TGA2.2 to the native as-1 element while binding to as-1-like promoter element from PR1a occurs to be inducible by SA treatment."],"dc:format":["application/pdf"],"dc:identifier":["https://hdl.handle.net/11858/00-1735-0000-0006-ABA3-C","https://dx.doi.org/10.53846/goediss-610","urn:nbn:de:gbv:7-webdoc-605-6","webdoc-605","509218199"],"dc:language":["ger"],"dc:rights":["https://webdoc.sub.gwdg.de/diss/copyr_diss.html"],"dc:subject":["570 Biowissenschaften, Biologie","Biologie","Chromatin-Immunopräzipitation","ChIP","Tabak","Pathogenabwehr","chromatin-immunoprecipitation","tobacco","pathogen defense","42.13","WF200"],"dc:title":["Etablierung und Anwendung der Chromatin-Immunopräzipitation für <i>in vivo</i>-Bindungsstudien der bZIP-Transkriptionsfaktoren TGA2.1 und TGA2.2 an Promotoren der Pathogenabwehr in Tabak","Establishment of the chromatin-immunoprecipitation for <i>in vivo</i>-binding studies of the bZIP transcription factors TGA2.1 and TGA2.2 at promotors of the pathogen defense response in tobacco"],"dc:type":["doctoralThesis"]},"updated_at":"2026-07-24T02:24:11Z"}