{"id":{"repo_id":"freiburg-diss","oai_identifier":"oai:freidok.uni-freiburg.de:629"},"canonical_url":"https://search.dev.ndltd.org/etd/freiburg-diss/oai:freidok.uni-freiburg.de:629","repository":{"repo_id":"freiburg-diss","name":"University of Freiburg","base_url":"https://freidok.uni-freiburg.de/oai/oai2.php"},"display":{"title":"Design und chemische Synthese von Häm- und Chlorophyll-bindenden Vier-Helix-Bündel-Proteinen","abstract":"Zur de novo Synthese von Proteinen werden Peptid-Fragmente definierter Sekundärstrukturen verknüpft. Eine erfolgreiche Strategie basiert auf dem TASP-Konzept (Template Assembled Synthetic Protein), bei dem Vier-Helix-Bündel durch Kopplung von helikalen Peptiden auf ein solides Templat-Molekül dargestellt werden. Zu deren Funktionalisierung können Metall-Kofaktoren, z.B. Häm, in den hydrophoben Kernbereich eingelagert werden. Diese Strategie wurde zu einer kombinatorischen Festphasensynthese weiterentwickelt, bei der einige Sätze von Peptiden unterschiedlicher Aminosäurezusammensetzung permutativ miteinander kombi-niert werden. Das ermöglicht beispielsweise die Synthese von 1000 Proteinen aus drei Sätzen à 10 Helices in verhältnismäßig kurzer Zeit, welche auf bestimmte Eigenschaften, z.B. Stabi-lität der Kofaktorbindung untersucht werden können. Computer-unterstütztes Design anhand von Struktur-Modellen half bei der Vorauswahl der Peptidsequenzen. Es wurden drei Biblio-theken unterschiedlicher Proteine hergestellt. Ein Ansatz diente der Suche nach Vier-Helix-Bündeln zur Bindung von Chl-Derivaten im hydrophoben Kern. Die beiden anderen Biblio-theken wurden hinsichtlich der axialen Koordination von Häm-Eisen an einen His- bzw. einen Cys-Rest im hydrophoben Bereich der Proteine untersucht, um die Häm-Bindung von Sauer-stoff-aktivierenden Enzymen (Oxidasen bzw. Cytochromen P450) nachzustellen. Absorpti-onsspektroskopische Untersuchungen der Protein-Bibliotheken ermöglichten Analysen der Einflüsse einzelner Aminosäure-Reste auf Kofaktor-Bindung und -Eigenschaften. Eine we-sentliche Neuentwicklung war das Screening von Absorptions-Kinetiken an Membran-gebundenen Proteinen, was den Weg zur Entwicklung synthetischer Enzyme ebnet. In allen drei Ansätzen wurden Proteine detektiert, die sich durch stabile Bindung der Kofaktoren im hydrophoben Bereich auszeichneten.","abstract_html":"Zur de novo Synthese von Proteinen werden Peptid-Fragmente definierter Sekundärstrukturen verknüpft. Eine erfolgreiche Strategie basiert auf dem TASP-Konzept (Template Assembled Synthetic Protein), bei dem Vier-Helix-Bündel durch Kopplung von helikalen Peptiden auf ein solides Templat-Molekül dargestellt werden. Zu deren Funktionalisierung können Metall-Kofaktoren, z.B. Häm, in den hydrophoben Kernbereich eingelagert werden. Diese Strategie wurde zu einer kombinatorischen Festphasensynthese weiterentwickelt, bei der einige Sätze von Peptiden unterschiedlicher Aminosäurezusammensetzung permutativ miteinander kombi-niert werden. Das ermöglicht beispielsweise die Synthese von 1000 Proteinen aus drei Sätzen à 10 Helices in verhältnismäßig kurzer Zeit, welche auf bestimmte Eigenschaften, z.B. Stabi-lität der Kofaktorbindung untersucht werden können. Computer-unterstütztes Design anhand von Struktur-Modellen half bei der Vorauswahl der Peptidsequenzen. Es wurden drei Biblio-theken unterschiedlicher Proteine hergestellt. Ein Ansatz diente der Suche nach Vier-Helix-Bündeln zur Bindung von Chl-Derivaten im hydrophoben Kern. Die beiden anderen Biblio-theken wurden hinsichtlich der axialen Koordination von Häm-Eisen an einen His- bzw. einen Cys-Rest im hydrophoben Bereich der Proteine untersucht, um die Häm-Bindung von Sauer-stoff-aktivierenden Enzymen (Oxidasen bzw. Cytochromen P450) nachzustellen. Absorpti-onsspektroskopische Untersuchungen der Protein-Bibliotheken ermöglichten Analysen der Einflüsse einzelner Aminosäure-Reste auf Kofaktor-Bindung und -Eigenschaften. Eine we-sentliche Neuentwicklung war das Screening von Absorptions-Kinetiken an Membran-gebundenen Proteinen, was den Weg zur Entwicklung synthetischer Enzyme ebnet. In allen drei Ansätzen wurden Proteine detektiert, die sich durch stabile Bindung der Kofaktoren im hydrophoben Bereich auszeichneten.","abstract_has_math":false,"creators":["Monien, Bernhard"],"institution":null,"degree_name":null,"degree_level":null,"degree_discipline":null,"degree_department":null,"school":null,"contributors":["Haehnel, Wolfgang"],"advisors":[],"committee_chairs":[],"committee_members":[],"year":null,"date_issued":"","date_published":null,"updated_at":"2026-07-24T02:21:46Z","subjects":["Vier-Helix-Bündel","four-helix bundle","heme","combinatorial proteindesign"],"languages":[],"rights":[],"rights_urls":[],"identifier_entries":[]},"links":{"outbound_url":"https://freidok.uni-freiburg.de/data/629","outbound_label":"Repository record","outbound_source":"source_url"},"metadata_groups":[{"id":"people","label":"People","entries":[{"key":"dc:contributor","label":"Contributor","values":["Haehnel, Wolfgang"]},{"key":"dc:creator","label":"Author","values":["Monien, Bernhard"]}]},{"id":"academic_context","label":"Academic Context","entries":[{"key":"dc:type","label":"Dc Type","values":["DoctoralThesis"]}]},{"id":"subjects_keywords","label":"Subjects and Keywords","entries":[{"key":"dc:subject","label":"Dc Subject","values":["Vier-Helix-Bündel","four-helix bundle","heme","combinatorial proteindesign"]}]},{"id":"additional","label":"Additional Metadata","entries":[{"key":"dc:description.abstract","label":"Abstract","values":["Zur de novo Synthese von Proteinen werden Peptid-Fragmente definierter Sekundärstrukturen verknüpft. Eine erfolgreiche Strategie basiert auf dem TASP-Konzept (Template Assembled Synthetic Protein), bei dem Vier-Helix-Bündel durch Kopplung von helikalen Peptiden auf ein solides Templat-Molekül dargestellt werden. Zu deren Funktionalisierung können Metall-Kofaktoren, z.B. Häm, in den hydrophoben Kernbereich eingelagert werden. Diese Strategie wurde zu einer kombinatorischen Festphasensynthese weiterentwickelt, bei der einige Sätze von Peptiden unterschiedlicher Aminosäurezusammensetzung permutativ miteinander kombi-niert werden. Das ermöglicht beispielsweise die Synthese von 1000 Proteinen aus drei Sätzen à 10 Helices in verhältnismäßig kurzer Zeit, welche auf bestimmte Eigenschaften, z.B. Stabi-lität der Kofaktorbindung untersucht werden können. Computer-unterstütztes Design anhand von Struktur-Modellen half bei der Vorauswahl der Peptidsequenzen. Es wurden drei Biblio-theken unterschiedlicher Proteine hergestellt. Ein Ansatz diente der Suche nach Vier-Helix-Bündeln zur Bindung von Chl-Derivaten im hydrophoben Kern. Die beiden anderen Biblio-theken wurden hinsichtlich der axialen Koordination von Häm-Eisen an einen His- bzw. einen Cys-Rest im hydrophoben Bereich der Proteine untersucht, um die Häm-Bindung von Sauer-stoff-aktivierenden Enzymen (Oxidasen bzw. Cytochromen P450) nachzustellen. Absorpti-onsspektroskopische Untersuchungen der Protein-Bibliotheken ermöglichten Analysen der Einflüsse einzelner Aminosäure-Reste auf Kofaktor-Bindung und -Eigenschaften. Eine we-sentliche Neuentwicklung war das Screening von Absorptions-Kinetiken an Membran-gebundenen Proteinen, was den Weg zur Entwicklung synthetischer Enzyme ebnet. In allen drei Ansätzen wurden Proteine detektiert, die sich durch stabile Bindung der Kofaktoren im hydrophoben Bereich auszeichneten."]},{"key":"dc:format.medium","label":"Dc Format Medium","values":["application/pdf"]},{"key":"dc:title","label":"Title","values":["Design und chemische Synthese von Häm- und Chlorophyll-bindenden Vier-Helix-Bündel-Proteinen","Design and chemical synthesis of heme and chlorophyll binding four-helix bundle proteins"]}]}],"canonical_facts":{"dc:contributor":["Haehnel, Wolfgang"],"dc:creator":["Monien, Bernhard"],"dc:description.abstract":["Zur de novo Synthese von Proteinen werden Peptid-Fragmente definierter Sekundärstrukturen verknüpft. Eine erfolgreiche Strategie basiert auf dem TASP-Konzept (Template Assembled Synthetic Protein), bei dem Vier-Helix-Bündel durch Kopplung von helikalen Peptiden auf ein solides Templat-Molekül dargestellt werden. Zu deren Funktionalisierung können Metall-Kofaktoren, z.B. Häm, in den hydrophoben Kernbereich eingelagert werden. Diese Strategie wurde zu einer kombinatorischen Festphasensynthese weiterentwickelt, bei der einige Sätze von Peptiden unterschiedlicher Aminosäurezusammensetzung permutativ miteinander kombi-niert werden. Das ermöglicht beispielsweise die Synthese von 1000 Proteinen aus drei Sätzen à 10 Helices in verhältnismäßig kurzer Zeit, welche auf bestimmte Eigenschaften, z.B. Stabi-lität der Kofaktorbindung untersucht werden können. Computer-unterstütztes Design anhand von Struktur-Modellen half bei der Vorauswahl der Peptidsequenzen. Es wurden drei Biblio-theken unterschiedlicher Proteine hergestellt. Ein Ansatz diente der Suche nach Vier-Helix-Bündeln zur Bindung von Chl-Derivaten im hydrophoben Kern. Die beiden anderen Biblio-theken wurden hinsichtlich der axialen Koordination von Häm-Eisen an einen His- bzw. einen Cys-Rest im hydrophoben Bereich der Proteine untersucht, um die Häm-Bindung von Sauer-stoff-aktivierenden Enzymen (Oxidasen bzw. Cytochromen P450) nachzustellen. Absorpti-onsspektroskopische Untersuchungen der Protein-Bibliotheken ermöglichten Analysen der Einflüsse einzelner Aminosäure-Reste auf Kofaktor-Bindung und -Eigenschaften. Eine we-sentliche Neuentwicklung war das Screening von Absorptions-Kinetiken an Membran-gebundenen Proteinen, was den Weg zur Entwicklung synthetischer Enzyme ebnet. In allen drei Ansätzen wurden Proteine detektiert, die sich durch stabile Bindung der Kofaktoren im hydrophoben Bereich auszeichneten."],"dc:format.medium":["application/pdf"],"dc:subject":["Vier-Helix-Bündel","four-helix bundle","heme","combinatorial proteindesign"],"dc:title":["Design und chemische Synthese von Häm- und Chlorophyll-bindenden Vier-Helix-Bündel-Proteinen","Design and chemical synthesis of heme and chlorophyll binding four-helix bundle proteins"],"dc:type":["DoctoralThesis"]},"updated_at":"2026-07-24T02:21:46Z"}