{"id":{"repo_id":"freiburg-diss","oai_identifier":"oai:freidok.uni-freiburg.de:1531"},"canonical_url":"https://search.dev.ndltd.org/etd/freiburg-diss/oai:freidok.uni-freiburg.de:1531","repository":{"repo_id":"freiburg-diss","name":"University of Freiburg","base_url":"https://freidok.uni-freiburg.de/oai/oai2.php"},"display":{"title":"Kartierung eines Genorts für Nephronophthise Typ 4 auf Chromosom 1p36 durch reverse Homozygotie-Kartierung","abstract":"Die Nephronophthise (NPH) ist eine zystische Nierenerkrankung mit autosomal-rezessivem Vererbungsmodus. Sie gilt als die häufigste Ursache chronischen Nierenversagens bei Kindern. Sie kann sowohl isoliert, das heißt, ohne weitere extrarenale Organbeteiligung, als auch im Zusammenhang mit Augen-, Leber-, und Knochenbeteiligung auftreten. Für die isolierte Nephronophthise konnten bislang drei Genorte kartiert werden.
Diese Arbeit beschäftigt sich mit der Kartierung des Genorts für einen weiteren Typ der Nephronophthise (Nephronophthise Typ 4, NPH4).
An insgesamt sechs Multiplexfamilien mit isolierter Nephronophthise wurde zunächst eine genomweite Kopplungsanalyse mit 373 Mikrosatelliten-Markern durchgeführt. Nach der Berechnung der LOD-Score-Werte ergab sich eine Region auf Chromosom 1p36 an welcher fünf der sechs untersuchten Familien mit Kopplung vereinbar waren. Im Folgenden wurde an dieser Stelle eine Feinkartierung mit Hilfe von polymorphen DNA-Markern in einer 22,9 cM umfassenden Region zwischen den Markern D1S243 und D1S244 durchgeführt. Innerhalb dieser Region lag zwischen den flankierenden Markern D1S2660 und D1S2642 ein 2,9 cM umfassendes Intervall, für welches alle drei betroffenen Individuen der untersuchten Familie F30 Homozygotie zeigten. Alle sechs untersuchten Familien waren in diesem Intervall mit Kopplung vereinbar.
Aufgrund der Homozygotie wurde für die Familie F30 das von Lander und Boltstein aufgestellte Paradigma zur Homozygotie-Kartierung in konsanguinen Familien in umgekehrter Reihenfolge angewandt und Homozygotie durch Abstammung postuliert. Mit Hilfe von Kirchenbucheinträgen konnte ein im Jahre 1677 geborener gemeinsamer Stammvater ausfindig gemacht werden. Durch diesen gemeinsamen Vorfahren konnte die postulierte Konsanguinität für die Familie F30 bestätigt werden.
LOD-Score-Berechnungen für diese Familie ergaben einen signifikanten Wert von
Zmax = 5,8 für den Marker D1S253. Die Berechnung der Multipoint-LOD-Score-Werte für elf zusätzliche Marker in der Region auf Chromosom 1p36.31 für alle untersuchten Familien ergab einen signifikanten Wert von Zmax = 8,9 für den Marker D1S253.
Auf diese Weise konnte ein neuer Genort (NPHP4) für eine neue Form der Nephronophthise mit hoher statistischer Sicherheit identifiziert werden.","abstract_html":"Die Nephronophthise (NPH) ist eine zystische Nierenerkrankung mit autosomal-rezessivem Vererbungsmodus. Sie gilt als die häufigste Ursache chronischen Nierenversagens bei Kindern. Sie kann sowohl isoliert, das heißt, ohne weitere extrarenale Organbeteiligung, als auch im Zusammenhang mit Augen-, Leber-, und Knochenbeteiligung auftreten. Für die isolierte Nephronophthise konnten bislang drei Genorte kartiert werden. <br>Diese Arbeit beschäftigt sich mit der Kartierung des Genorts für einen weiteren Typ der Nephronophthise (Nephronophthise Typ 4, NPH4). <br>An insgesamt sechs Multiplexfamilien mit isolierter Nephronophthise wurde zunächst eine genomweite Kopplungsanalyse mit 373 Mikrosatelliten-Markern durchgeführt. Nach der Berechnung der LOD-Score-Werte ergab sich eine Region auf Chromosom 1p36 an welcher fünf der sechs untersuchten Familien mit Kopplung vereinbar waren. Im Folgenden wurde an dieser Stelle eine Feinkartierung mit Hilfe von polymorphen DNA-Markern in einer 22,9 cM umfassenden Region zwischen den Markern D1S243 und D1S244 durchgeführt. Innerhalb dieser Region lag zwischen den flankierenden Markern D1S2660 und D1S2642 ein 2,9 cM umfassendes Intervall, für welches alle drei betroffenen Individuen der untersuchten Familie F30 Homozygotie zeigten. Alle sechs untersuchten Familien waren in diesem Intervall mit Kopplung vereinbar. <br>Aufgrund der Homozygotie wurde für die Familie F30 das von Lander und Boltstein aufgestellte Paradigma zur Homozygotie-Kartierung in konsanguinen Familien in umgekehrter Reihenfolge angewandt und Homozygotie durch Abstammung postuliert. Mit Hilfe von Kirchenbucheinträgen konnte ein im Jahre 1677 geborener gemeinsamer Stammvater ausfindig gemacht werden. Durch diesen gemeinsamen Vorfahren konnte die postulierte Konsanguinität für die Familie F30 bestätigt werden. <br>LOD-Score-Berechnungen für diese Familie ergaben einen signifikanten Wert von <br>Zmax = 5,8 für den Marker D1S253. Die Berechnung der Multipoint-LOD-Score-Werte für elf zusätzliche Marker in der Region auf Chromosom 1p36.31 für alle untersuchten Familien ergab einen signifikanten Wert von Zmax = 8,9 für den Marker D1S253. <br>Auf diese Weise konnte ein neuer Genort (NPHP4) für eine neue Form der Nephronophthise mit hoher statistischer Sicherheit identifiziert werden.","abstract_has_math":false,"creators":["Becker, Achim"],"institution":null,"degree_name":null,"degree_level":null,"degree_discipline":null,"degree_department":null,"school":null,"contributors":["Hildebrandt, Friedhelm"],"advisors":[],"committee_chairs":[],"committee_members":[],"year":null,"date_issued":"","date_published":null,"updated_at":"2026-07-24T02:22:16Z","subjects":["Lod Score","Consanguinity","Homozygote","Kidney Failure","Genetic Markers"],"languages":[],"rights":[],"rights_urls":[],"identifier_entries":[]},"links":{"outbound_url":"https://freidok.uni-freiburg.de/data/1531","outbound_label":"Repository record","outbound_source":"source_url"},"metadata_groups":[{"id":"people","label":"People","entries":[{"key":"dc:contributor","label":"Contributor","values":["Hildebrandt, Friedhelm"]},{"key":"dc:creator","label":"Author","values":["Becker, Achim"]}]},{"id":"academic_context","label":"Academic Context","entries":[{"key":"dc:type","label":"Dc Type","values":["DoctoralThesis"]}]},{"id":"subjects_keywords","label":"Subjects and Keywords","entries":[{"key":"dc:subject","label":"Dc Subject","values":["Lod Score","Consanguinity","Homozygote","Kidney Failure","Genetic Markers"]}]},{"id":"additional","label":"Additional Metadata","entries":[{"key":"dc:description.abstract","label":"Abstract","values":["Die Nephronophthise (NPH) ist eine zystische Nierenerkrankung mit autosomal-rezessivem Vererbungsmodus. Sie gilt als die häufigste Ursache chronischen Nierenversagens bei Kindern. Sie kann sowohl isoliert, das heißt, ohne weitere extrarenale Organbeteiligung, als auch im Zusammenhang mit Augen-, Leber-, und Knochenbeteiligung auftreten. Für die isolierte Nephronophthise konnten bislang drei Genorte kartiert werden.
Diese Arbeit beschäftigt sich mit der Kartierung des Genorts für einen weiteren Typ der Nephronophthise (Nephronophthise Typ 4, NPH4).
An insgesamt sechs Multiplexfamilien mit isolierter Nephronophthise wurde zunächst eine genomweite Kopplungsanalyse mit 373 Mikrosatelliten-Markern durchgeführt. Nach der Berechnung der LOD-Score-Werte ergab sich eine Region auf Chromosom 1p36 an welcher fünf der sechs untersuchten Familien mit Kopplung vereinbar waren. Im Folgenden wurde an dieser Stelle eine Feinkartierung mit Hilfe von polymorphen DNA-Markern in einer 22,9 cM umfassenden Region zwischen den Markern D1S243 und D1S244 durchgeführt. Innerhalb dieser Region lag zwischen den flankierenden Markern D1S2660 und D1S2642 ein 2,9 cM umfassendes Intervall, für welches alle drei betroffenen Individuen der untersuchten Familie F30 Homozygotie zeigten. Alle sechs untersuchten Familien waren in diesem Intervall mit Kopplung vereinbar.
Aufgrund der Homozygotie wurde für die Familie F30 das von Lander und Boltstein aufgestellte Paradigma zur Homozygotie-Kartierung in konsanguinen Familien in umgekehrter Reihenfolge angewandt und Homozygotie durch Abstammung postuliert. Mit Hilfe von Kirchenbucheinträgen konnte ein im Jahre 1677 geborener gemeinsamer Stammvater ausfindig gemacht werden. Durch diesen gemeinsamen Vorfahren konnte die postulierte Konsanguinität für die Familie F30 bestätigt werden.
LOD-Score-Berechnungen für diese Familie ergaben einen signifikanten Wert von
Zmax = 5,8 für den Marker D1S253. Die Berechnung der Multipoint-LOD-Score-Werte für elf zusätzliche Marker in der Region auf Chromosom 1p36.31 für alle untersuchten Familien ergab einen signifikanten Wert von Zmax = 8,9 für den Marker D1S253.
Auf diese Weise konnte ein neuer Genort (NPHP4) für eine neue Form der Nephronophthise mit hoher statistischer Sicherheit identifiziert werden.","Nephronophthisis (NPH) is a cystic kidney disease of autosomal-recessive heredity. It is the primary cause of chronic renal failure in children. It can occur isloted, that is without other extrarenal manifestations, as well as in association with eye- liver- and bone disorders. So far, three genome loci have been identified for isolated nephronophthisis.
This dissertation deals with the mapping of a genome locus for yet another type of nephronophthisis (nephronophthisis type 4, NPH4).
In a total of six multiplex families with isolated nephronophthisis a totale-genome linkage analysis was performed with 373 microsatelite markers. After calculating the LOD-score a region on chromosome 1p36 was identified on which five out of the six screened families showed linkage. A fine mapping using polymorphic DNA-markers was in a region spanning 22.9 cM between the flanking markers D1S243 and D1S244 was performed. Within this region lay a 2.9 cM encompassing intervall between the flanking markers D1S2660 and D1S2642 for which all three affected individuals of family F30 showed homozygosity. All six tested families were compatible with linkage within that region.
By virtue of the homozygosity in family F30, the paradigm of Lander and Boltstein concerning homozygosity mapping in consanguinous families was used in a reverse way, and homozygosity by descent was postulated. Using parish registers, a common ancestor who was born in 1677 was discoverd. Thus the postulated consanguinity in family F30 could be confirmed. LOD-score calculations in this family yielded a significant value of Zmax = 5.8 for the marker D1S253. The calculation of multipoint-LOD scores for eleven additional markers in the region on chromosome 1p36.31 for all examined families yielded a significant value of Zmax = 8.9 for the marker D1S253.
We thus identified a new locus, NPHP4, for nephronophthisis."]},{"key":"dc:format.medium","label":"Dc Format Medium","values":["application/pdf"]},{"key":"dc:title","label":"Title","values":["Kartierung eines Genorts für Nephronophthise Typ 4 auf Chromosom 1p36 durch reverse Homozygotie-Kartierung","Mapping of gene loci for Nephronophthisis type 4 to chromosome 1p36 through reverse homozygosity mapping"]}]}],"canonical_facts":{"dc:contributor":["Hildebrandt, Friedhelm"],"dc:creator":["Becker, Achim"],"dc:description.abstract":["Die Nephronophthise (NPH) ist eine zystische Nierenerkrankung mit autosomal-rezessivem Vererbungsmodus. Sie gilt als die häufigste Ursache chronischen Nierenversagens bei Kindern. Sie kann sowohl isoliert, das heißt, ohne weitere extrarenale Organbeteiligung, als auch im Zusammenhang mit Augen-, Leber-, und Knochenbeteiligung auftreten. Für die isolierte Nephronophthise konnten bislang drei Genorte kartiert werden.
Diese Arbeit beschäftigt sich mit der Kartierung des Genorts für einen weiteren Typ der Nephronophthise (Nephronophthise Typ 4, NPH4).
An insgesamt sechs Multiplexfamilien mit isolierter Nephronophthise wurde zunächst eine genomweite Kopplungsanalyse mit 373 Mikrosatelliten-Markern durchgeführt. Nach der Berechnung der LOD-Score-Werte ergab sich eine Region auf Chromosom 1p36 an welcher fünf der sechs untersuchten Familien mit Kopplung vereinbar waren. Im Folgenden wurde an dieser Stelle eine Feinkartierung mit Hilfe von polymorphen DNA-Markern in einer 22,9 cM umfassenden Region zwischen den Markern D1S243 und D1S244 durchgeführt. Innerhalb dieser Region lag zwischen den flankierenden Markern D1S2660 und D1S2642 ein 2,9 cM umfassendes Intervall, für welches alle drei betroffenen Individuen der untersuchten Familie F30 Homozygotie zeigten. Alle sechs untersuchten Familien waren in diesem Intervall mit Kopplung vereinbar.
Aufgrund der Homozygotie wurde für die Familie F30 das von Lander und Boltstein aufgestellte Paradigma zur Homozygotie-Kartierung in konsanguinen Familien in umgekehrter Reihenfolge angewandt und Homozygotie durch Abstammung postuliert. Mit Hilfe von Kirchenbucheinträgen konnte ein im Jahre 1677 geborener gemeinsamer Stammvater ausfindig gemacht werden. Durch diesen gemeinsamen Vorfahren konnte die postulierte Konsanguinität für die Familie F30 bestätigt werden.
LOD-Score-Berechnungen für diese Familie ergaben einen signifikanten Wert von
Zmax = 5,8 für den Marker D1S253. Die Berechnung der Multipoint-LOD-Score-Werte für elf zusätzliche Marker in der Region auf Chromosom 1p36.31 für alle untersuchten Familien ergab einen signifikanten Wert von Zmax = 8,9 für den Marker D1S253.
Auf diese Weise konnte ein neuer Genort (NPHP4) für eine neue Form der Nephronophthise mit hoher statistischer Sicherheit identifiziert werden.","Nephronophthisis (NPH) is a cystic kidney disease of autosomal-recessive heredity. It is the primary cause of chronic renal failure in children. It can occur isloted, that is without other extrarenal manifestations, as well as in association with eye- liver- and bone disorders. So far, three genome loci have been identified for isolated nephronophthisis.
This dissertation deals with the mapping of a genome locus for yet another type of nephronophthisis (nephronophthisis type 4, NPH4).
In a total of six multiplex families with isolated nephronophthisis a totale-genome linkage analysis was performed with 373 microsatelite markers. After calculating the LOD-score a region on chromosome 1p36 was identified on which five out of the six screened families showed linkage. A fine mapping using polymorphic DNA-markers was in a region spanning 22.9 cM between the flanking markers D1S243 and D1S244 was performed. Within this region lay a 2.9 cM encompassing intervall between the flanking markers D1S2660 and D1S2642 for which all three affected individuals of family F30 showed homozygosity. All six tested families were compatible with linkage within that region.
By virtue of the homozygosity in family F30, the paradigm of Lander and Boltstein concerning homozygosity mapping in consanguinous families was used in a reverse way, and homozygosity by descent was postulated. Using parish registers, a common ancestor who was born in 1677 was discoverd. Thus the postulated consanguinity in family F30 could be confirmed. LOD-score calculations in this family yielded a significant value of Zmax = 5.8 for the marker D1S253. The calculation of multipoint-LOD scores for eleven additional markers in the region on chromosome 1p36.31 for all examined families yielded a significant value of Zmax = 8.9 for the marker D1S253.
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