{"id":{"repo_id":"freiburg-diss","oai_identifier":"oai:freidok.uni-freiburg.de:1216"},"canonical_url":"https://search.dev.ndltd.org/etd/freiburg-diss/oai:freidok.uni-freiburg.de:1216","repository":{"repo_id":"freiburg-diss","name":"University of Freiburg","base_url":"https://freidok.uni-freiburg.de/oai/oai2.php"},"display":{"title":"Die transkriptionelle Regulation des roughest Gens in Drosophila melanogaster","abstract":"Roughest (Rst) ist ein Zelladhäsionsmolekül der Immunoglobulin-Superfamilie, das vielfältige Funktionen während der Entwicklung von Drosophila melanogaster einnimmt. Rst spielt unter anderem eine wichtige Rolle bei der axonalen Wegfindung in den optischen Loben, bei Zellsortierungen vor apoptotischen Prozessen im sich entwickelnden Komplexauge und bei Fusionen von Myoblasten zur embryonalen Muskulatur. In Übereinstimmung mit seiner pleiotrophen Wirkung zeigt Rst ein dynamisches Expressionsmuster in den betreffenden Geweben während der Entwicklung von Drosophila. Zudem findet sich Rst in Geweben wie der embryonalen Mittellinie, in denen die Funktionen von Rst bisher unbekannt sind.
Um einen Zugang für weitere Funktionen von Rst zu bekommen und um rst in das genregulatorische Netzwerk von Drosophila einzuordnen, wird in der vorliegenden Arbeit die transkriptionelle Regulation von rst untersucht. Durch die Identifizierung der Transkriptionsstartstelle von rst kann gezeigt werden, dass das rst Gen einen Promotor mit einem Initiator-Element und Downstream-Promoter-Elementen, aber ohne TATA-Box besitzt. In einem sogenannten Enhancer-Detection-Screen wurden cis-regulatorische rst Sequenzen identifiziert und durch die Konstruktion von rst-Gal4 Linien charakterisiert. Hierdurch kann gezeigt werden, dass das rst Gen durch eine komplexe Anordnung von Enhancer-Modulen reguliert wird. Unter anderem sind spezifische rst cis-regulatorische Sequenzen identifizierbar, die eine Expression in der embryonalen Mittellinie, in der embryonalen Muskulatur und in Interommatidialzellen des sich entwickelnden Komplexauges vermitteln.
Die in der vorliegenden Arbeit konstruierten rst-Gal4 Linien stellen hochspezifische experimentelle Werkzeuge dar und wurden in der vorliegenden Arbeit für eine gezielte Überexpression von Rst und seiner Interaktionspartner Hibris und Sticks-and-stones in Interommatidialzellen eingesetzt.
Um Regulatoren der rst Expression zu identifizieren, wurde mit Hilfe des Gal4/UAS-Systems in Drosophila ein Screen für Faktoren durchgeführt, die in der Lage sind, eine ektopische Aktivierung der rst Expression zu initiieren. Zudem wurden diese Faktoren darauf getestet, ob sie diese Aktivierung der rst Expression über die identifizierten rst cis-regulatorischen Sequenzen vermitteln. Hierdurch kann gezeigt werden, dass rst cis-regulatorische Sequenzen durch Single minded (Sim), Dmef2 und nukleare Effektoren der Ras-MAPK und Notch Signalwege aktiviert werden. Innerhalb dieser aktivierbaren rst cis-regulatorischen Sequenzen befinden sich Enhancer-Module, die eine mit der bekannten Wirkung der einzelnen Faktoren korrelierbare Reportergenexpression vermitteln. Sim, das Genprodukt des Selektorgens der embryonalen Mittellinie, wirkt auf eine rst cis-regulatorische Sequenz, die Enhancer für eine Expression in der embryonalen Mittellinie enthält. Dmef2 ist ein essentieller Faktor während der Entwicklung der embryonalen Muskulatur und wirkt auf rst cis-regulatorische Sequenzen, die in der embryonalen Muskulatur aktiviert werden. Eine Regulation der rst Expression durch Dmef2 liefert eine Erklärung für Muskelfusionsdefekte in Dmef2 Embryonen. Der Ras-MAPK und der Notch Signalweg spielen unter anderem bei apoptotischen Prozessen eine wichtige Rolle und wirken auf eine rst cis-regulatorische Sequenz, die kurz vor apoptotischen Prozessen in den Interommatidialzellen aktiviert wird. Diese Aktivierung von rst durch das Ras-MAPK Überlebenssignal und das proapoptotische Notch Signal bietet Hinweise für bisher unbekannte Funktionen von Rst bei apoptotischen Prozessen. Eine Sequenzanalyse der rst cis-regulatorischen DNA zeigt, dass sich innerhalb der betreffenden rst Enhancer-Module Konsensusbindungsstellen für Sim, Dmef2 und die nuklearen Effektoren der Ras-MAPK und Notch Signalwege befinden, die zwischen D. melanogaster und D. pseudoobscura konserviert sind.
In dieser Arbeit wird gezeigt, dass Rst in der embryonalen Mittellinie von sim Mutanten nicht exprimiert ist. Um zu testen, ob die beiden identifizierten Sim-Konsensusbindungsstellen des rst Mittellinien-Enhancers in vivo funktional sind, wurde eine zielgerichtete Mutagenese dieser Sequenzen im betreffenden rst Reportergenkonstrukt durchgeführt. Diese mutagenisierten rst cis- Sequenzen können keine Reportergenexpression in der frühen embryonalen Mittellinie vermitteln. Während der Entwicklung der optischen Loben wird rst hingegen nicht durch Sim reguliert.","abstract_html":"Roughest (Rst) ist ein Zelladhäsionsmolekül der Immunoglobulin-Superfamilie, das vielfältige Funktionen während der Entwicklung von Drosophila melanogaster einnimmt. Rst spielt unter anderem eine wichtige Rolle bei der axonalen Wegfindung in den optischen Loben, bei Zellsortierungen vor apoptotischen Prozessen im sich entwickelnden Komplexauge und bei Fusionen von Myoblasten zur embryonalen Muskulatur. In Übereinstimmung mit seiner pleiotrophen Wirkung zeigt Rst ein dynamisches Expressionsmuster in den betreffenden Geweben während der Entwicklung von Drosophila. Zudem findet sich Rst in Geweben wie der embryonalen Mittellinie, in denen die Funktionen von Rst bisher unbekannt sind. <br>Um einen Zugang für weitere Funktionen von Rst zu bekommen und um rst in das genregulatorische Netzwerk von Drosophila einzuordnen, wird in der vorliegenden Arbeit die transkriptionelle Regulation von rst untersucht. Durch die Identifizierung der Transkriptionsstartstelle von rst kann gezeigt werden, dass das rst Gen einen Promotor mit einem Initiator-Element und Downstream-Promoter-Elementen, aber ohne TATA-Box besitzt. In einem sogenannten Enhancer-Detection-Screen wurden cis-regulatorische rst Sequenzen identifiziert und durch die Konstruktion von rst-Gal4 Linien charakterisiert. Hierdurch kann gezeigt werden, dass das rst Gen durch eine komplexe Anordnung von Enhancer-Modulen reguliert wird. Unter anderem sind spezifische rst cis-regulatorische Sequenzen identifizierbar, die eine Expression in der embryonalen Mittellinie, in der embryonalen Muskulatur und in Interommatidialzellen des sich entwickelnden Komplexauges vermitteln. <br>Die in der vorliegenden Arbeit konstruierten rst-Gal4 Linien stellen hochspezifische experimentelle Werkzeuge dar und wurden in der vorliegenden Arbeit für eine gezielte Überexpression von Rst und seiner Interaktionspartner Hibris und Sticks-and-stones in Interommatidialzellen eingesetzt. <br>Um Regulatoren der rst Expression zu identifizieren, wurde mit Hilfe des Gal4/UAS-Systems in Drosophila ein Screen für Faktoren durchgeführt, die in der Lage sind, eine ektopische Aktivierung der rst Expression zu initiieren. Zudem wurden diese Faktoren darauf getestet, ob sie diese Aktivierung der rst Expression über die identifizierten rst cis-regulatorischen Sequenzen vermitteln. Hierdurch kann gezeigt werden, dass rst cis-regulatorische Sequenzen durch Single minded (Sim), Dmef2 und nukleare Effektoren der Ras-MAPK und Notch Signalwege aktiviert werden. Innerhalb dieser aktivierbaren rst cis-regulatorischen Sequenzen befinden sich Enhancer-Module, die eine mit der bekannten Wirkung der einzelnen Faktoren korrelierbare Reportergenexpression vermitteln. Sim, das Genprodukt des Selektorgens der embryonalen Mittellinie, wirkt auf eine rst cis-regulatorische Sequenz, die Enhancer für eine Expression in der embryonalen Mittellinie enthält. Dmef2 ist ein essentieller Faktor während der Entwicklung der embryonalen Muskulatur und wirkt auf rst cis-regulatorische Sequenzen, die in der embryonalen Muskulatur aktiviert werden. Eine Regulation der rst Expression durch Dmef2 liefert eine Erklärung für Muskelfusionsdefekte in Dmef2 Embryonen. Der Ras-MAPK und der Notch Signalweg spielen unter anderem bei apoptotischen Prozessen eine wichtige Rolle und wirken auf eine rst cis-regulatorische Sequenz, die kurz vor apoptotischen Prozessen in den Interommatidialzellen aktiviert wird. Diese Aktivierung von rst durch das Ras-MAPK Überlebenssignal und das proapoptotische Notch Signal bietet Hinweise für bisher unbekannte Funktionen von Rst bei apoptotischen Prozessen. Eine Sequenzanalyse der rst cis-regulatorischen DNA zeigt, dass sich innerhalb der betreffenden rst Enhancer-Module Konsensusbindungsstellen für Sim, Dmef2 und die nuklearen Effektoren der Ras-MAPK und Notch Signalwege befinden, die zwischen D. melanogaster und D. pseudoobscura konserviert sind. <br>In dieser Arbeit wird gezeigt, dass Rst in der embryonalen Mittellinie von sim Mutanten nicht exprimiert ist. Um zu testen, ob die beiden identifizierten Sim-Konsensusbindungsstellen des rst Mittellinien-Enhancers in vivo funktional sind, wurde eine zielgerichtete Mutagenese dieser Sequenzen im betreffenden rst Reportergenkonstrukt durchgeführt. Diese mutagenisierten rst cis- Sequenzen können keine Reportergenexpression in der frühen embryonalen Mittellinie vermitteln. 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Um einen Zugang für weitere Funktionen von Rst zu bekommen und um rst in das genregulatorische Netzwerk von Drosophila einzuordnen, wird in der vorliegenden Arbeit die transkriptionelle Regulation von rst untersucht. Durch die Identifizierung der Transkriptionsstartstelle von rst kann gezeigt werden, dass das rst Gen einen Promotor mit einem Initiator-Element und Downstream-Promoter-Elementen, aber ohne TATA-Box besitzt. In einem sogenannten Enhancer-Detection-Screen wurden cis-regulatorische rst Sequenzen identifiziert und durch die Konstruktion von rst-Gal4 Linien charakterisiert. Hierdurch kann gezeigt werden, dass das rst Gen durch eine komplexe Anordnung von Enhancer-Modulen reguliert wird. Unter anderem sind spezifische rst cis-regulatorische Sequenzen identifizierbar, die eine Expression in der embryonalen Mittellinie, in der embryonalen Muskulatur und in Interommatidialzellen des sich entwickelnden Komplexauges vermitteln.
Die in der vorliegenden Arbeit konstruierten rst-Gal4 Linien stellen hochspezifische experimentelle Werkzeuge dar und wurden in der vorliegenden Arbeit für eine gezielte Überexpression von Rst und seiner Interaktionspartner Hibris und Sticks-and-stones in Interommatidialzellen eingesetzt.
Um Regulatoren der rst Expression zu identifizieren, wurde mit Hilfe des Gal4/UAS-Systems in Drosophila ein Screen für Faktoren durchgeführt, die in der Lage sind, eine ektopische Aktivierung der rst Expression zu initiieren. Zudem wurden diese Faktoren darauf getestet, ob sie diese Aktivierung der rst Expression über die identifizierten rst cis-regulatorischen Sequenzen vermitteln. Hierdurch kann gezeigt werden, dass rst cis-regulatorische Sequenzen durch Single minded (Sim), Dmef2 und nukleare Effektoren der Ras-MAPK und Notch Signalwege aktiviert werden. Innerhalb dieser aktivierbaren rst cis-regulatorischen Sequenzen befinden sich Enhancer-Module, die eine mit der bekannten Wirkung der einzelnen Faktoren korrelierbare Reportergenexpression vermitteln. Sim, das Genprodukt des Selektorgens der embryonalen Mittellinie, wirkt auf eine rst cis-regulatorische Sequenz, die Enhancer für eine Expression in der embryonalen Mittellinie enthält. Dmef2 ist ein essentieller Faktor während der Entwicklung der embryonalen Muskulatur und wirkt auf rst cis-regulatorische Sequenzen, die in der embryonalen Muskulatur aktiviert werden. Eine Regulation der rst Expression durch Dmef2 liefert eine Erklärung für Muskelfusionsdefekte in Dmef2 Embryonen. Der Ras-MAPK und der Notch Signalweg spielen unter anderem bei apoptotischen Prozessen eine wichtige Rolle und wirken auf eine rst cis-regulatorische Sequenz, die kurz vor apoptotischen Prozessen in den Interommatidialzellen aktiviert wird. Diese Aktivierung von rst durch das Ras-MAPK Überlebenssignal und das proapoptotische Notch Signal bietet Hinweise für bisher unbekannte Funktionen von Rst bei apoptotischen Prozessen. Eine Sequenzanalyse der rst cis-regulatorischen DNA zeigt, dass sich innerhalb der betreffenden rst Enhancer-Module Konsensusbindungsstellen für Sim, Dmef2 und die nuklearen Effektoren der Ras-MAPK und Notch Signalwege befinden, die zwischen D. melanogaster und D. pseudoobscura konserviert sind.
In dieser Arbeit wird gezeigt, dass Rst in der embryonalen Mittellinie von sim Mutanten nicht exprimiert ist. Um zu testen, ob die beiden identifizierten Sim-Konsensusbindungsstellen des rst Mittellinien-Enhancers in vivo funktional sind, wurde eine zielgerichtete Mutagenese dieser Sequenzen im betreffenden rst Reportergenkonstrukt durchgeführt. Diese mutagenisierten rst cis- Sequenzen können keine Reportergenexpression in der frühen embryonalen Mittellinie vermitteln. Während der Entwicklung der optischen Loben wird rst hingegen nicht durch Sim reguliert.","Roughest (Rst) is a cell adhesion molecule of the immunoglobulin superfamily that has several functions during the development of Drosophila melanogaster. Rst is important for axonal pathfinding in the optic lobes, for cell sorting processes before apoptosis in the developing compound eye and for myoblast fusion in the embryo. In accordance with its multiple functions Rst shows a dynamic expression pattern throughout the development of Drosophila. Apart from expression in the above mentioned tissues, Rst is also expressed in the embryonic midline where no function has been attributed so far.
The theme of the present thesis is the transcriptional regulation of rst. The aim of this study is to get insight into putative additional functions of Rst and to embed rst in the gene regulatory network of Drosophila development.
The identification of the transcription start site of rst shows that the rst promoter does not contain a TATA box upstream of an initiator element, but might be using downstream promoter elements. In an enhancer detection screen rst cis regulatory sequences were identified. Characterization of these sequences was done by the construction of rst-Gal4 lines. In these studies it is shown that the rst expression is regulated by a complex array of cis regulatory modules. Among others specific cis regulatory modules for expression in the embryonic midline, in the embryonic musculature and in interommatidial cells (IOC) of the developing compound eye were identified.
The constructed rst-Gal4 lines can be used as an experimental tool for misexpression studies in specific expression domains of rst. In this thesis this was done by misexpression of Rst and its interaction partners Hibris (Hbs) and Sticks-and-stones (Sns) in IOC.
To identify regulators of rst expression an in vivo screen for activators of rst expression was performed using the Gal4/UAS system in Drosophila. Additionally, putative activators were tested if they act on the identified rst cis regulatory sequences. In these studies it is shown that Single minded (Sim), Dmef2 and nuclear effectors of the Ras-MAPK and Notch pathways are activators of rst expression and that they act on specific rst cis regulatory sequences. These sequences contain regulatory modules for expression in patterns that can be correlated with the known activity patterns of the corresponding factors. Sim, the gene product of the selector gene of the embryonic midline, acts on a rst cis regulatory sequence that contains a regulatory module for expression in the embryonic midline. Dmef2 is a factor essential for embryonic muscle development and acts on rst cis regulatory sequences that are activated in the embryonic musculature. The Ras-MAPK and Notch pathways function among others in apoptotic cell fate decisions. They act on a rst cis regulatory sequence that is activated immediately before apoptotic decisions are made in IOC of the developing compound eye. The activation of rst by the Ras-MAPK survival signal and the proapoptotic Notch pathway might point to so far unknown functions of Rst in apoptotic processes. Sequence analysis of the rst cis regulatory sequences shows that consensus binding sites of Sim, Dmef2 and nuclear effectors of the Ras-MAPK and Notch pathways can be found in the corresponding rst regulatory modules. These consensus binding sites are conserved between Drosophila melanogaster and Drosophila pseudoobscura.
The regulation of rst by Sim was studied in detail. Rst is not expressed in the embryonic midline of sim mutants. To test for the functionality of the two identified Sim consensus binding sites in the rst midline regulatory module a site directed mutagenesis of both Sim consensus binding sites in the corresponding reporter gene construct was performed. In vivo analysis of the mutated reporter gene construct shows that expression in the early embryonic midline depends on these Sim consensus binding sites. However, mutant analysis shows that rst is not regulated by Sim during postembryonic development of the optic lobes."]},{"key":"dc:format.medium","label":"Dc Format Medium","values":["application/pdf"]},{"key":"dc:title","label":"Title","values":["Die transkriptionelle Regulation des roughest Gens in Drosophila melanogaster","Transcriptional regulation of the roughest gene in Drosophila melanogaster"]}]}],"canonical_facts":{"dc:contributor":["Fischbach, Karl-Friedrich"],"dc:creator":["Apitz, Holger"],"dc:description.abstract":["Roughest (Rst) ist ein Zelladhäsionsmolekül der Immunoglobulin-Superfamilie, das vielfältige Funktionen während der Entwicklung von Drosophila melanogaster einnimmt. Rst spielt unter anderem eine wichtige Rolle bei der axonalen Wegfindung in den optischen Loben, bei Zellsortierungen vor apoptotischen Prozessen im sich entwickelnden Komplexauge und bei Fusionen von Myoblasten zur embryonalen Muskulatur. In Übereinstimmung mit seiner pleiotrophen Wirkung zeigt Rst ein dynamisches Expressionsmuster in den betreffenden Geweben während der Entwicklung von Drosophila. Zudem findet sich Rst in Geweben wie der embryonalen Mittellinie, in denen die Funktionen von Rst bisher unbekannt sind.
Um einen Zugang für weitere Funktionen von Rst zu bekommen und um rst in das genregulatorische Netzwerk von Drosophila einzuordnen, wird in der vorliegenden Arbeit die transkriptionelle Regulation von rst untersucht. Durch die Identifizierung der Transkriptionsstartstelle von rst kann gezeigt werden, dass das rst Gen einen Promotor mit einem Initiator-Element und Downstream-Promoter-Elementen, aber ohne TATA-Box besitzt. In einem sogenannten Enhancer-Detection-Screen wurden cis-regulatorische rst Sequenzen identifiziert und durch die Konstruktion von rst-Gal4 Linien charakterisiert. Hierdurch kann gezeigt werden, dass das rst Gen durch eine komplexe Anordnung von Enhancer-Modulen reguliert wird. Unter anderem sind spezifische rst cis-regulatorische Sequenzen identifizierbar, die eine Expression in der embryonalen Mittellinie, in der embryonalen Muskulatur und in Interommatidialzellen des sich entwickelnden Komplexauges vermitteln.
Die in der vorliegenden Arbeit konstruierten rst-Gal4 Linien stellen hochspezifische experimentelle Werkzeuge dar und wurden in der vorliegenden Arbeit für eine gezielte Überexpression von Rst und seiner Interaktionspartner Hibris und Sticks-and-stones in Interommatidialzellen eingesetzt.
Um Regulatoren der rst Expression zu identifizieren, wurde mit Hilfe des Gal4/UAS-Systems in Drosophila ein Screen für Faktoren durchgeführt, die in der Lage sind, eine ektopische Aktivierung der rst Expression zu initiieren. Zudem wurden diese Faktoren darauf getestet, ob sie diese Aktivierung der rst Expression über die identifizierten rst cis-regulatorischen Sequenzen vermitteln. Hierdurch kann gezeigt werden, dass rst cis-regulatorische Sequenzen durch Single minded (Sim), Dmef2 und nukleare Effektoren der Ras-MAPK und Notch Signalwege aktiviert werden. Innerhalb dieser aktivierbaren rst cis-regulatorischen Sequenzen befinden sich Enhancer-Module, die eine mit der bekannten Wirkung der einzelnen Faktoren korrelierbare Reportergenexpression vermitteln. Sim, das Genprodukt des Selektorgens der embryonalen Mittellinie, wirkt auf eine rst cis-regulatorische Sequenz, die Enhancer für eine Expression in der embryonalen Mittellinie enthält. Dmef2 ist ein essentieller Faktor während der Entwicklung der embryonalen Muskulatur und wirkt auf rst cis-regulatorische Sequenzen, die in der embryonalen Muskulatur aktiviert werden. Eine Regulation der rst Expression durch Dmef2 liefert eine Erklärung für Muskelfusionsdefekte in Dmef2 Embryonen. Der Ras-MAPK und der Notch Signalweg spielen unter anderem bei apoptotischen Prozessen eine wichtige Rolle und wirken auf eine rst cis-regulatorische Sequenz, die kurz vor apoptotischen Prozessen in den Interommatidialzellen aktiviert wird. Diese Aktivierung von rst durch das Ras-MAPK Überlebenssignal und das proapoptotische Notch Signal bietet Hinweise für bisher unbekannte Funktionen von Rst bei apoptotischen Prozessen. Eine Sequenzanalyse der rst cis-regulatorischen DNA zeigt, dass sich innerhalb der betreffenden rst Enhancer-Module Konsensusbindungsstellen für Sim, Dmef2 und die nuklearen Effektoren der Ras-MAPK und Notch Signalwege befinden, die zwischen D. melanogaster und D. pseudoobscura konserviert sind.
In dieser Arbeit wird gezeigt, dass Rst in der embryonalen Mittellinie von sim Mutanten nicht exprimiert ist. Um zu testen, ob die beiden identifizierten Sim-Konsensusbindungsstellen des rst Mittellinien-Enhancers in vivo funktional sind, wurde eine zielgerichtete Mutagenese dieser Sequenzen im betreffenden rst Reportergenkonstrukt durchgeführt. Diese mutagenisierten rst cis- Sequenzen können keine Reportergenexpression in der frühen embryonalen Mittellinie vermitteln. Während der Entwicklung der optischen Loben wird rst hingegen nicht durch Sim reguliert.","Roughest (Rst) is a cell adhesion molecule of the immunoglobulin superfamily that has several functions during the development of Drosophila melanogaster. Rst is important for axonal pathfinding in the optic lobes, for cell sorting processes before apoptosis in the developing compound eye and for myoblast fusion in the embryo. In accordance with its multiple functions Rst shows a dynamic expression pattern throughout the development of Drosophila. Apart from expression in the above mentioned tissues, Rst is also expressed in the embryonic midline where no function has been attributed so far.
The theme of the present thesis is the transcriptional regulation of rst. The aim of this study is to get insight into putative additional functions of Rst and to embed rst in the gene regulatory network of Drosophila development.
The identification of the transcription start site of rst shows that the rst promoter does not contain a TATA box upstream of an initiator element, but might be using downstream promoter elements. In an enhancer detection screen rst cis regulatory sequences were identified. Characterization of these sequences was done by the construction of rst-Gal4 lines. In these studies it is shown that the rst expression is regulated by a complex array of cis regulatory modules. Among others specific cis regulatory modules for expression in the embryonic midline, in the embryonic musculature and in interommatidial cells (IOC) of the developing compound eye were identified.
The constructed rst-Gal4 lines can be used as an experimental tool for misexpression studies in specific expression domains of rst. In this thesis this was done by misexpression of Rst and its interaction partners Hibris (Hbs) and Sticks-and-stones (Sns) in IOC.
To identify regulators of rst expression an in vivo screen for activators of rst expression was performed using the Gal4/UAS system in Drosophila. Additionally, putative activators were tested if they act on the identified rst cis regulatory sequences. In these studies it is shown that Single minded (Sim), Dmef2 and nuclear effectors of the Ras-MAPK and Notch pathways are activators of rst expression and that they act on specific rst cis regulatory sequences. These sequences contain regulatory modules for expression in patterns that can be correlated with the known activity patterns of the corresponding factors. Sim, the gene product of the selector gene of the embryonic midline, acts on a rst cis regulatory sequence that contains a regulatory module for expression in the embryonic midline. Dmef2 is a factor essential for embryonic muscle development and acts on rst cis regulatory sequences that are activated in the embryonic musculature. The Ras-MAPK and Notch pathways function among others in apoptotic cell fate decisions. They act on a rst cis regulatory sequence that is activated immediately before apoptotic decisions are made in IOC of the developing compound eye. The activation of rst by the Ras-MAPK survival signal and the proapoptotic Notch pathway might point to so far unknown functions of Rst in apoptotic processes. Sequence analysis of the rst cis regulatory sequences shows that consensus binding sites of Sim, Dmef2 and nuclear effectors of the Ras-MAPK and Notch pathways can be found in the corresponding rst regulatory modules. These consensus binding sites are conserved between Drosophila melanogaster and Drosophila pseudoobscura.
The regulation of rst by Sim was studied in detail. Rst is not expressed in the embryonic midline of sim mutants. To test for the functionality of the two identified Sim consensus binding sites in the rst midline regulatory module a site directed mutagenesis of both Sim consensus binding sites in the corresponding reporter gene construct was performed. In vivo analysis of the mutated reporter gene construct shows that expression in the early embryonic midline depends on these Sim consensus binding sites. However, mutant analysis shows that rst is not regulated by Sim during postembryonic development of the optic lobes."],"dc:format.medium":["application/pdf"],"dc:subject":["Drosophila","Developmental biology","Gene regulation"],"dc:title":["Die transkriptionelle Regulation des roughest Gens in Drosophila melanogaster","Transcriptional regulation of the roughest gene in Drosophila melanogaster"],"dc:type":["DoctoralThesis"]},"updated_at":"2026-07-24T02:22:03Z"}