Evoluzione Biologica Simulata: Una proposta meccanicistica per la causalità verso il basso
L'obiettivo di questo progetto di ricerca è utilizzare la biologia computazionale e i metodi di inferenza causale per fare luce sulla controversia filosofica riguardante l'architettura causale multilivello dell'evoluzione dei sistemi biologici. In particolare, i nostri sforzi si concentrano sulla derivazione della causalità discendente (top-down) come meccanismo che agisce in un sistema biologico, così come la sua controparte ascendente (bottom-up). Crediamo anche che una conclusione secondaria di questo impegno sarebbe valutare se ci sia spazio per una spiegazione agentiva della selezione naturale, nel senso di fornire un quadro per districare i sotto-meccanismi coinvolti nell'evoluzione di un sistema biologico, o ispirato alla biologia. La struttura del lavoro comprende tre macro-sezioni, iniziando con la creazione di un modello computazionale (modello basato su agenti) della cripta colica, proseguendo con il modello standard comunemente usato in genetica delle popolazioni per misurare la selezione naturale delle frequenze alleliche e il formalismo dell'equazione di Price. L'ultima sezione riguarda i metodi di inferenza causale, come i grafici aciclici diretti e il calcolo dei controfattuali, che forniscono la struttura formale e rigorosa da cui deriviamo le nostre conclusioni sulla natura delle relazioni causali nell'evoluzione di un sistema ispirato alla biologia. La logica alla base della struttura del lavoro è la seguente: se il modello computazionale è coerente con le informazioni fornite dai metodi sperimentali tradizionali, presenta caratteristiche evolutive convincenti e consente la costruzione di un modello causale per la dinamica del sistema, allora sarà possibile delineare il meccanismo discendente operante nel sistema.
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