Aplicación web interactiva para minería de textos: Análisis del Síndrome de Williams-Beuren

La finalidad de este trabajo fin de máster ha sido el desarrollo de una aplicación web interactiva con Shiny Dashboard, para realizar minería de textos usando el paquete de R pubmed.mineR, sobre un corpus obtenido de Pubmed. A partir de este corpus se puede navegar por los abstracts que lo componen, permitiendo posteriormente linkar con Pubmed para descargar el documento completo. Permite aplicar filtros, para encontrar los abstracts que contienen un término o un gen. Es posible también obtener las palabras y genes más frecuentes, y luego mostrar la nube de palabras y genes. También permite obtener la información existente en Uniprot para cada gen. Por último ofrece la posibilidad de obtener las enfermedades más comunes relacionadas con el corpus obtenido a través de Pubtator, y sobre ellas averiguar, si existen, las relaciones de similitud de dichas enfermedades con genes, a partir de un análisis semántico latente y la similitud del coseno. Usando la aplicación se ha realizado un análisis sobre un corpus formado por 1580 abstracts, sobre el Síndrome de Williams-Beuren, trastorno del neurodesarrollo que se presenta desde el mismo momento del nacimiento del individuo, provocado por la pérdida de más de veinticinco genes, como GTF2I, GTF2IRD1, GTF2IRD2, ELN, LIMK1, STX1A, BAZIB, BCL7B y F2D9, en el cromosoma 7 en la posición 11.23. Este trastorno del neurodesarrollo puede provocar entre otras enfermedades, estenosis aórtica supravalvular, hipersociabilidad, deficits en cognición social, pérdida auditiva neurosensorial, hipercalcemia, retraso en el crecimiento y dismorfismo facial.

Grantor dc:publisher

Universitat Oberta de Catalunya (UOC)

Year dc:date.issued

2018

Author dc:creator

• Natividad López, M.Pilar

• síndrome Williams-Beuren
• aplicaciones web
• minería de textos
• PubMed
• aplicacions web
• mineria de textos
• web applications
• text mining
• Williams-Beuren syndrome

Statement dc:rights

• CC BY-NC-ND

Licence dc:rights.uri

• http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/es/

Language dc:language.iso

spa

Handle dc:identifier.uri

http://hdl.handle.net/10609/90066

OAI identifier oai:identifier

oai:openaccess.uoc.edu:10609/90066