Determinación del proteoma del dinoflagelado Pyrocystis lunula y estudio de sus aplicaciones biotecnológicas

Se muestra aquí el primer análisis molecular de Pyrocystis lunula utilizando enfoques tanto transcriptómicos como proteómicos ("ómico"). P. lunula es un dinoflagelado marino que históricamente ha recibido atención debido a su capacidad bioluminiscente según los ritmos circadianos y actualmente existen varias aplicaciones biotecnológicas derivadas de este sistema en esta especie. Por este motivo se empleó un enfoque "ómico" utilizando muestras de P. lunula frescas. Como resultado se generaron un total de 80.874.825 lecturas en bruto (11.292.087.505 pb; 55,82 % GC) mediante secuenciación de ARNm. Las secuencias fueron ensambladas en 414.295 contigs (219.203.407 pb; 55,38 % GC) por el software Trinity, generando un transcriptoma de referencia que se empleó posteriormente para llevar a cabo el primer análisis proteómico en P. lunula. Se identificaron un total de 17.461 péptidos y 3.182 proteínas. Las proteínas identificadas se categorizaron de acuerdo con la descripción funcional y la clasificación de ontología de genes. Los resultados proteómicos representan una pieza valiosa en la comprensión del mecanismo bioluminiscente de P. lunula a nivel molecular y arrojan luz sobre la identificación de factores importantes involucrados en la regulación de la expresión génica. Destaca la presencia de la proteína de unión a luciferina (LBP), que no se había descrito hasta el momento en el género Pyrocystis. Los mecanismos celulares y moleculares que subyacen al fenómeno bioluminiscente en dinoflagelados están caracterizados, sin embargo, todavía existen algunos aspectos que siguen siendo un enigma. Tal es el caso de la presencia y diversidad de la proteína “luciferin binding protein” (LBP), así como el proceso de síntesis de luciferina. Estos son factores que son estudiados, estableciendose nuevas perspectivas en relación con los elementos moleculares responsables de este fenómeno, así como sobre la función de la bioluminiscencia en los dinoflagelados.

Author dc:creator

• Fajardo Quiñones, Carlos

Advisors dc:contributor.advisor

• Fernández Acero, Francisco Javier
• Mancera Romero, Juan Miguel

• Microalgas
• Dinoflagelado
• Bioluminiscencia
• Biología Molecular
• Transcriptómica
• Proteómica

Statement dc:rights

• Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 Internacional

Licence dc:rights.uri

• http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/

Language dc:language.iso

spa

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http://hdl.handle.net/10498/23502

OAI identifier oai:identifier

oai:rodin.uca.es:10498/23502