Rede de interação proteína-proteína na relação entre Rickettsia amblyommatis e células do intestino e ovário de Amblyomma sculptum (Berlese, 1888)
type: CreativeWork
description: As riquétsias são bactérias intracelulares obrigatórias de hospedeiros vertebrados e invertebrados, diferindo em termos de associação com artrópodes, comportamento dos vetores invertebrados à infecção, na fisiopatologia e desfecho da doença em vertebrados. Entretanto, apesar de saber-se ser o carrapato reservatório e vetor destes microrganismos, os mecanismos moleculares envolvidos na infecção de suas células não foram bem elucidados. Assim, o trabalho teve como objetivo a reconstrução in silico da rede de interação proteína-proteína, a partir de proteínas codificadas do genoma da bactéria Rickettsia amblyommatis e do carrapato Ixodes scapularis. Com o alinhamento das sequências proteicas identificadas, conforme preconizado por diferentes bancos de interações (PSIMAP, iPfam, STRING e PEIMAP), obteve-se uma rede consenso após a normalização dos dados através do cálculo do valor de confiança da interação. Com o auxílio de ferramentas preditivas de localização subcelular, foram selecionadas proteínas de R. amblyommatis com alto potencial de interação com o carrapato e de grande importância para o processo infeccioso, sendo identificadas proteínas secretadas, excretadas e, ou, de superfície. Avaliando a rede de proteínas de membrana predita, foram identificadas 3.546 interações, envolvendo 91 proteínas de membrana da bactéria e 980 proteínas do carrapato. Por ontologia gênica foram identificados os processos biológicos significativos envolvidos na modulação da fisiologia do carrapato pela bactéria. Os módulos encontrados revelaram diferentes vias de sinalização, como, p. ex., secreção, fosforilação de aminoácidos e proteínas e alongamento translacional. Com o intuito de validar a rede obtida, foi realizada a integração dos transcriptomas de intestino e ovário de carrapatos Amblyomma sculptum em resposta à infecção por R. amblyommatis. Com esta estratégia foi possível revelar genes e interações protéicas derivadas de evidências in silico que podem auxiliar estudos adicio…
abstract: As riquétsias são bactérias intracelulares obrigatórias de hospedeiros vertebrados e invertebrados, diferindo em termos de associação com artrópodes, comportamento dos vetores invertebrados à infecção, na fisiopatologia e desfecho da doença em vertebrados. Entretanto, apesar de saber-se ser o carrapato reservatório e vetor destes microrganismos, os mecanismos moleculares envolvidos na infecção de suas células não foram bem elucidados. Assim, o trabalho teve como objetivo a reconstrução in silico da rede de interação proteína-proteína, a partir de proteínas codificadas do genoma da bactéria Rickettsia amblyommatis e do carrapato Ixodes scapularis. Com o alinhamento das sequências proteicas identificadas, conforme preconizado por diferentes bancos de interações (PSIMAP, iPfam, STRING e PEIMAP), obteve-se uma rede consenso após a normalização dos dados através do cálculo do valor de confiança da interação. Com o auxílio de ferramentas preditivas de localização subcelular, foram selecionadas proteínas de R. amblyommatis com alto potencial de interação com o carrapato e de grande importância para o processo infeccioso, sendo identificadas proteínas secretadas, excretadas e, ou, de superfície. Avaliando a rede de proteínas de membrana predita, foram identificadas 3.546 interações, envolvendo 91 proteínas de membrana da bactéria e 980 proteínas do carrapato. Por ontologia gênica foram identificados os processos biológicos significativos envolvidos na modulação da fisiologia do carrapato pela bactéria. Os módulos encontrados revelaram diferentes vias de sinalização, como, p. ex., secreção, fosforilação de aminoácidos e proteínas e alongamento translacional. Com o intuito de validar a rede obtida, foi realizada a integração dos transcriptomas de intestino e ovário de carrapatos Amblyomma sculptum em resposta à infecção por R. amblyommatis. Com esta estratégia foi possível revelar genes e interações protéicas derivadas de evidências in silico que podem auxiliar estudos adicio…
author: Dias, Raquel Xavier Ligeiro
language: por
keywords: Carrapatos, Vetores de doenças, Interações proteína-proteína - Modelos matemáticos
date published: 2020-02-21
date modified: 2026-07-24T01:21:00Z
provider: Brazil UFV
publisher: Networked Digital Library of Theses and Dissertations
type: WebPage
source organization: Universidade Federal de Viçosa