{"id":{"repo_id":"athens","oai_identifier":"oai:lib.uoa.gr:uoadl:5425364"},"canonical_url":"https://search.dev.ndltd.org/etd/athens/oai:lib.uoa.gr:uoadl:5425364","repository":{"repo_id":"athens","name":"National and Kapodistrian University of Athens","base_url":"https://pergamos.lib.uoa.gr/uoa/dl/frontend/oaipmh"},"display":{"title":"Ο ρόλος του εναλλακτικού ματίσματος στη γήρανση","abstract":"Το εναλλακτικό μάτισμα αποτελεί μια αυστηρά ρυθμιζόμενη διαδικασία που αυξάνει την πρωτεομική ποικιλομορφία και υποστηρίζει την προσαρμοστικότητα του κυττάρου κατά την ανάπτυξη του οργανισμού αλλά και σε συνθήκες στρες. Ωστόσο, η πιστότητα της διαδικασίας του ματίσματος φθίνει με την πάροδο της ηλικίας, συμβάλλοντας στην απορρύθμιση πολλών, ηλικιακά εξαρτώμενων κυτταρικών διεργασιών, συμπεριλαμβανομένης της αυτοφαγίας. Η αυτοφαγία είναι μια εξελικτικά συντηρημένη καταβολική διαδικασία, απαραίτητη για την κυτταρική ομοιόσταση και την αντοχή στο στρες, η εξασθένηση της οποίας έχει συνδεθεί άμεσα με τη φθορά που συνοδεύει τη γήρανση. Βιοπληροφορική ανάλυση δεδομένων από νεαρούς (ημέρα 1) και γηρασμένους (ημέρες 7 και 10) νηματώδεις Caenorhabditis elegans ανέδειξε μια πληθώρα διαφοροποιημένα εκφραζόμενων γονιδίων, τα οποία εμφάνισαν σημαντικό εμπλουτισμό σε όρους Οντολογίας Γονιδίων (Gene Ontology) που σχετίζονται με την αυτοφαγική ρύθμιση. Επαληθεύτηκε στη συνέχεια και πειραματικά ότι το γονίδιο atg-18, ένας συντηρημένος μεσολαβητής της PI3K και ορθόλογο των WIPI1/2 που απαντώνται στα θηλαστικά, παράγει δύο διακριτές ισομορφές μέσω εναλλακτικής επιλογής μιας θέσης συρραφής στο 3′ άκρο του μορίου (Alt′3). Η ένταξη αυτής της εναλλακτικής θέσης συρραφής διαπιστώθηκε ότι μειώνεται κατά τη γήρανση, γεγονός που συνοδεύεται από τη μείωση της αφθονίας της ισομορφής β και την αύξηση των συνολικών επιπέδων της πρωτεΐνης ATG-18. Η πρωτεομική ανάλυση που χρησιμοποιήθηκε για διαλογή ηλικιακά ρυθμιζόμενων παραγόντων συρραφής, ανέδειξε τις πρωτεΐνες-ρυθμιστές του εναλλακτικού ματίσματος TEG-4 και GLD-1 ως ρυθμιστές της αναλογίας των ισομορφών του atg-18. Λειτουργικές αναλύσεις έδειξαν ότι και οι δύο αυτοί παράγοντες είναι απαραίτητοι για τη φυσιολογική αυτοφαγική λειτουργία, την κινητικότητα των νηματώδων αλλά και τη διατήρηση του προσδόκιμου ζωής τους. Ωστόσο, ο παράγοντας TEG-4 αναδεικνύεται ως ο ισχυρότερος υποψήφιος ρυθμιστής, συνδέοντας άμεσα τον έλεγχο των θέσεων συρραφής με την αυτοφαγία και τη γήρανση του οργανισμού στον C. elegans.","abstract_html":"Το εναλλακτικό μάτισμα αποτελεί μια αυστηρά ρυθμιζόμενη διαδικασία που αυξάνει την πρωτεομική ποικιλομορφία και υποστηρίζει την προσαρμοστικότητα του κυττάρου κατά την ανάπτυξη του οργανισμού αλλά και σε συνθήκες στρες. Ωστόσο, η πιστότητα της διαδικασίας του ματίσματος φθίνει με την πάροδο της ηλικίας, συμβάλλοντας στην απορρύθμιση πολλών, ηλικιακά εξαρτώμενων κυτταρικών διεργασιών, συμπεριλαμβανομένης της αυτοφαγίας. Η αυτοφαγία είναι μια εξελικτικά συντηρημένη καταβολική διαδικασία, απαραίτητη για την κυτταρική ομοιόσταση και την αντοχή στο στρες, η εξασθένηση της οποίας έχει συνδεθεί άμεσα με τη φθορά που συνοδεύει τη γήρανση. Βιοπληροφορική ανάλυση δεδομένων από νεαρούς (ημέρα 1) και γηρασμένους (ημέρες 7 και 10) νηματώδεις Caenorhabditis elegans ανέδειξε μια πληθώρα διαφοροποιημένα εκφραζόμενων γονιδίων, τα οποία εμφάνισαν σημαντικό εμπλουτισμό σε όρους Οντολογίας Γονιδίων (Gene Ontology) που σχετίζονται με την αυτοφαγική ρύθμιση. Επαληθεύτηκε στη συνέχεια και πειραματικά ότι το γονίδιο atg-18, ένας συντηρημένος μεσολαβητής της PI3K και ορθόλογο των WIPI1/2 που απαντώνται στα θηλαστικά, παράγει δύο διακριτές ισομορφές μέσω εναλλακτικής επιλογής μιας θέσης συρραφής στο 3′ άκρο του μορίου (Alt′3). Η ένταξη αυτής της εναλλακτικής θέσης συρραφής διαπιστώθηκε ότι μειώνεται κατά τη γήρανση, γεγονός που συνοδεύεται από τη μείωση της αφθονίας της ισομορφής β και την αύξηση των συνολικών επιπέδων της πρωτεΐνης ATG-18. Η πρωτεομική ανάλυση που χρησιμοποιήθηκε για διαλογή ηλικιακά ρυθμιζόμενων παραγόντων συρραφής, ανέδειξε τις πρωτεΐνες-ρυθμιστές του εναλλακτικού ματίσματος TEG-4 και GLD-1 ως ρυθμιστές της αναλογίας των ισομορφών του atg-18. Λειτουργικές αναλύσεις έδειξαν ότι και οι δύο αυτοί παράγοντες είναι απαραίτητοι για τη φυσιολογική αυτοφαγική λειτουργία, την κινητικότητα των νηματώδων αλλά και τη διατήρηση του προσδόκιμου ζωής τους. Ωστόσο, ο παράγοντας TEG-4 αναδεικνύεται ως ο ισχυρότερος υποψήφιος ρυθμιστής, συνδέοντας άμεσα τον έλεγχο των θέσεων συρραφής με την αυτοφαγία και τη γήρανση του οργανισμού στον C. elegans.","abstract_has_math":false,"creators":["Τσαμαδιά Ελένη","Tsamadia Eleni"],"institution":null,"degree_name":null,"degree_level":null,"degree_discipline":null,"degree_department":null,"school":null,"contributors":[],"advisors":[],"committee_chairs":[],"committee_members":[],"year":2026,"date_issued":"2026","date_published":"2026","updated_at":"2026-08-21T16:41:59Z","subjects":["Επιστήμες Υγείας","Health Sciences"],"languages":["English"],"rights":[],"rights_urls":[],"identifier_entries":[{"key":"dc:identifier","label":"Identifier","values":["uoadl:5425364"],"render_values":[{"text":"uoadl:5425364","href":null,"code":true}]}]},"links":{"outbound_url":"https://pergamos.lib.uoa.gr/uoa/dl/object/5425364","outbound_label":"Repository record","outbound_source":"dc:identifier"},"source_record":{"url":"https://pergamos.lib.uoa.gr/uoa/dl/frontend/oaipmh?verb=GetRecord&metadataPrefix=oai_dc&identifier=oai%3Alib.uoa.gr%3Auoadl%3A5425364","prefix":"oai_dc"},"metadata_groups":[{"id":"people","label":"People","entries":[{"key":"dc:creator","label":"Author","values":["Τσαμαδιά Ελένη","Tsamadia Eleni"]}]},{"id":"academic_context","label":"Academic Context","entries":[{"key":"dc:date","label":"Dc Date","values":["2026"]},{"key":"dc:type","label":"Dc Type","values":["born_digital_postgraduate_thesis","Διπλωματική Εργασία","Postgraduate Thesis"]}]},{"id":"subjects_keywords","label":"Subjects and Keywords","entries":[{"key":"dc:subject","label":"Dc Subject","values":["Επιστήμες Υγείας","Health Sciences"]}]},{"id":"language_rights","label":"Language and Rights","entries":[{"key":"dc:language","label":"Dc Language","values":["English"]}]},{"id":"identifiers","label":"Identifiers","entries":[{"key":"dc:identifier","label":"Identifier","values":["uoadl:5425364","https://pergamos.lib.uoa.gr/uoa/dl/object/5425364"]}]},{"id":"additional","label":"Additional Metadata","entries":[{"key":"dc:description","label":"Description","values":["Το εναλλακτικό μάτισμα αποτελεί μια αυστηρά ρυθμιζόμενη διαδικασία που αυξάνει την πρωτεομική ποικιλομορφία και υποστηρίζει την προσαρμοστικότητα του κυττάρου κατά την ανάπτυξη του οργανισμού αλλά και σε συνθήκες στρες. Ωστόσο, η πιστότητα της διαδικασίας του ματίσματος φθίνει με την πάροδο της ηλικίας, συμβάλλοντας στην απορρύθμιση πολλών, ηλικιακά εξαρτώμενων κυτταρικών διεργασιών, συμπεριλαμβανομένης της αυτοφαγίας. Η αυτοφαγία είναι μια εξελικτικά συντηρημένη καταβολική διαδικασία, απαραίτητη για την κυτταρική ομοιόσταση και την αντοχή στο στρες, η εξασθένηση της οποίας έχει συνδεθεί άμεσα με τη φθορά που συνοδεύει τη γήρανση. Βιοπληροφορική ανάλυση δεδομένων από νεαρούς (ημέρα 1) και γηρασμένους (ημέρες 7 και 10) νηματώδεις Caenorhabditis elegans ανέδειξε μια πληθώρα διαφοροποιημένα εκφραζόμενων γονιδίων, τα οποία εμφάνισαν σημαντικό εμπλουτισμό σε όρους Οντολογίας Γονιδίων (Gene Ontology) που σχετίζονται με την αυτοφαγική ρύθμιση. Επαληθεύτηκε στη συνέχεια και πειραματικά ότι το γονίδιο atg-18, ένας συντηρημένος μεσολαβητής της PI3K και ορθόλογο των WIPI1/2 που απαντώνται στα θηλαστικά, παράγει δύο διακριτές ισομορφές μέσω εναλλακτικής επιλογής μιας θέσης συρραφής στο 3′ άκρο του μορίου (Alt′3). Η ένταξη αυτής της εναλλακτικής θέσης συρραφής διαπιστώθηκε ότι μειώνεται κατά τη γήρανση, γεγονός που συνοδεύεται από τη μείωση της αφθονίας της ισομορφής β και την αύξηση των συνολικών επιπέδων της πρωτεΐνης ATG-18. Η πρωτεομική ανάλυση που χρησιμοποιήθηκε για διαλογή ηλικιακά ρυθμιζόμενων παραγόντων συρραφής, ανέδειξε τις πρωτεΐνες-ρυθμιστές του εναλλακτικού ματίσματος TEG-4 και GLD-1 ως ρυθμιστές της αναλογίας των ισομορφών του atg-18. Λειτουργικές αναλύσεις έδειξαν ότι και οι δύο αυτοί παράγοντες είναι απαραίτητοι για τη φυσιολογική αυτοφαγική λειτουργία, την κινητικότητα των νηματώδων αλλά και τη διατήρηση του προσδόκιμου ζωής τους. Ωστόσο, ο παράγοντας TEG-4 αναδεικνύεται ως ο ισχυρότερος υποψήφιος ρυθμιστής, συνδέοντας άμεσα τον έλεγχο των θέσεων συρραφής με την αυτοφαγία και τη γήρανση του οργανισμού στον C. elegans.","Alternative splicing is a highly regulated process that expands proteomic diversity and enables cellular adaptation during development and stress. However, splicing fidelity declines with age, contributing to the dysregulation of multiple age-related processes, including autophagy. Autophagy is a conserved catabolic pathway essential for cellular homeostasis and stress resilience, and its impairment has been strongly linked to ageing and age-associated functional decline. Bioinformatic analysis of young (day 1) and aged (days 7 and 10) C. elegans identified several differentially expressed genes enriched in Gene Ontology terms related to autophagy regulation. Among these, atg-18, a conserved PI3K effector and orthologue of mammalian WIPI1/2, emerged as a key candidate. Experimental validation demonstrated that atg-18 generates two isoforms via alternative 3′ splice-site usage, with reduced inclusion of the alternative site during ageing. This age-dependent splicing shift was accompanied by decreased abundance of isoform b and increased total ATG-18 protein levels. Screening of age-associated splicing regulators identified TEG-4 and GLD-1 as modulators of atg-18 isoform balance. Functional analyses further showed that both factors are required for the maintenance of normal autophagic activity, locomotion and lifespan. Notably, TEG-4 emerges as the strongest upstream regulator, establishing a mechanistic link between splice-site selection, autophagy and organismal ageing in C. elegans."]},{"key":"dc:title","label":"Title","values":["Ο ρόλος του εναλλακτικού ματίσματος στη γήρανση"]}]}],"canonical_facts":{"dc:creator":["Τσαμαδιά Ελένη","Tsamadia Eleni"],"dc:date":["2026"],"dc:description":["Το εναλλακτικό μάτισμα αποτελεί μια αυστηρά ρυθμιζόμενη διαδικασία που αυξάνει την πρωτεομική ποικιλομορφία και υποστηρίζει την προσαρμοστικότητα του κυττάρου κατά την ανάπτυξη του οργανισμού αλλά και σε συνθήκες στρες. Ωστόσο, η πιστότητα της διαδικασίας του ματίσματος φθίνει με την πάροδο της ηλικίας, συμβάλλοντας στην απορρύθμιση πολλών, ηλικιακά εξαρτώμενων κυτταρικών διεργασιών, συμπεριλαμβανομένης της αυτοφαγίας. Η αυτοφαγία είναι μια εξελικτικά συντηρημένη καταβολική διαδικασία, απαραίτητη για την κυτταρική ομοιόσταση και την αντοχή στο στρες, η εξασθένηση της οποίας έχει συνδεθεί άμεσα με τη φθορά που συνοδεύει τη γήρανση. Βιοπληροφορική ανάλυση δεδομένων από νεαρούς (ημέρα 1) και γηρασμένους (ημέρες 7 και 10) νηματώδεις Caenorhabditis elegans ανέδειξε μια πληθώρα διαφοροποιημένα εκφραζόμενων γονιδίων, τα οποία εμφάνισαν σημαντικό εμπλουτισμό σε όρους Οντολογίας Γονιδίων (Gene Ontology) που σχετίζονται με την αυτοφαγική ρύθμιση. Επαληθεύτηκε στη συνέχεια και πειραματικά ότι το γονίδιο atg-18, ένας συντηρημένος μεσολαβητής της PI3K και ορθόλογο των WIPI1/2 που απαντώνται στα θηλαστικά, παράγει δύο διακριτές ισομορφές μέσω εναλλακτικής επιλογής μιας θέσης συρραφής στο 3′ άκρο του μορίου (Alt′3). Η ένταξη αυτής της εναλλακτικής θέσης συρραφής διαπιστώθηκε ότι μειώνεται κατά τη γήρανση, γεγονός που συνοδεύεται από τη μείωση της αφθονίας της ισομορφής β και την αύξηση των συνολικών επιπέδων της πρωτεΐνης ATG-18. Η πρωτεομική ανάλυση που χρησιμοποιήθηκε για διαλογή ηλικιακά ρυθμιζόμενων παραγόντων συρραφής, ανέδειξε τις πρωτεΐνες-ρυθμιστές του εναλλακτικού ματίσματος TEG-4 και GLD-1 ως ρυθμιστές της αναλογίας των ισομορφών του atg-18. Λειτουργικές αναλύσεις έδειξαν ότι και οι δύο αυτοί παράγοντες είναι απαραίτητοι για τη φυσιολογική αυτοφαγική λειτουργία, την κινητικότητα των νηματώδων αλλά και τη διατήρηση του προσδόκιμου ζωής τους. Ωστόσο, ο παράγοντας TEG-4 αναδεικνύεται ως ο ισχυρότερος υποψήφιος ρυθμιστής, συνδέοντας άμεσα τον έλεγχο των θέσεων συρραφής με την αυτοφαγία και τη γήρανση του οργανισμού στον C. elegans.","Alternative splicing is a highly regulated process that expands proteomic diversity and enables cellular adaptation during development and stress. However, splicing fidelity declines with age, contributing to the dysregulation of multiple age-related processes, including autophagy. Autophagy is a conserved catabolic pathway essential for cellular homeostasis and stress resilience, and its impairment has been strongly linked to ageing and age-associated functional decline. Bioinformatic analysis of young (day 1) and aged (days 7 and 10) C. elegans identified several differentially expressed genes enriched in Gene Ontology terms related to autophagy regulation. Among these, atg-18, a conserved PI3K effector and orthologue of mammalian WIPI1/2, emerged as a key candidate. Experimental validation demonstrated that atg-18 generates two isoforms via alternative 3′ splice-site usage, with reduced inclusion of the alternative site during ageing. This age-dependent splicing shift was accompanied by decreased abundance of isoform b and increased total ATG-18 protein levels. Screening of age-associated splicing regulators identified TEG-4 and GLD-1 as modulators of atg-18 isoform balance. Functional analyses further showed that both factors are required for the maintenance of normal autophagic activity, locomotion and lifespan. Notably, TEG-4 emerges as the strongest upstream regulator, establishing a mechanistic link between splice-site selection, autophagy and organismal ageing in C. elegans."],"dc:identifier":["uoadl:5425364","https://pergamos.lib.uoa.gr/uoa/dl/object/5425364"],"dc:language":["English"],"dc:subject":["Επιστήμες Υγείας","Health Sciences"],"dc:title":["Ο ρόλος του εναλλακτικού ματίσματος στη γήρανση"],"dc:type":["born_digital_postgraduate_thesis","Διπλωματική Εργασία","Postgraduate Thesis"]},"updated_at":"2026-08-21T16:41:59Z"}