{"id":{"repo_id":"amu-pl","oai_identifier":"oai:repozytorium.amu.edu.pl:10593/24476"},"canonical_url":"https://search.dev.ndltd.org/etd/amu-pl/oai:repozytorium.amu.edu.pl:10593/24476","repository":{"repo_id":"amu-pl","name":"Poznan","base_url":"https://repozytorium.amu.edu.pl/server/oai/request"},"display":{"title":"Fluorescencyjne sondy oligonukleotydowe oparte na strukturze G-kwadrupleksu, ich charakterystyka i oddziaływanie z monowarstwą Langmuira","abstract":"Tematyka rozprawy doktorskiej skupia się na opracowaniu i charakterystyce fluorescencyjnych sond do monitorowania jonów potasu, bazujących na strukturze G-kwadrupleksu (G4 DNA) z wykorzystaniem techniki Langmuira. Zaprojektowano i scharakteryzowano spektroskopowo (spektrofotometria UV-vis, fluorescencja, dichroizm kołowy) oligonukleotydowe sondy fluorescencyjne, znakowane hydrofobowym ugrupowaniem (kotwica cholesterolowa) oraz znacznikami fluorescencyjnymi (FRET, py, Upy i AgNCs). Badania spektralne, potwierdziły, że tak zaprojektowane układy analityczne generują sygnał analityczny w obecności kationów metali alkalicznych i wykazują wyższą czułość w stosunku do jonów K+ (w porównaniu z jonami Na+). Rejestracja izoterm π-A dla monowarstwy DODAB w obecności sond oraz widm fluorescencyjnych kompleksów sonda/DODAB na granicy faz woda/powietrze techniką światłowodową, pozwoliły uzyskać wgląd w procesy interakcji sonda-monowarstwa i oszacować oddziaływanie sondy z kationami metali. Końcowym etapem badań było monitorowanie jonów K+ przy powierzchni błony biologicznej (komórki HeLa) w oparciu o najbardziej obiecujące układy sonda/DODAB (Ch(F-TBA-T), Ch(py-TBA-py)). Z sukcesem udało się zaobserwować, że badane sondy mają potencjał jako biosensory do detekcji jonów K+. Badania zawarte w niniejszej rozprawie doktorskiej są przedsięwzięciem całkowicie nowatorskim, zarówno w aspekcie badania kwadrupleksowego DNA techniką Langmuira, jak i w obszarze prowadzenia badań fotofizycznych sond na granicy faz monowarstwa/faza wodna. The subject of the doctoral dissertation focuses on the development and characterization of fluorescent probes for monitoring potassium ions, which are based on the G-quadruplex (G4 DNA) structure and are investigated in bulk solution as well as using the Langmuir technique. Oligonucleotide fluorescent probes labeled with a hydrophobic moiety (cholesterol anchor) and fluorescent tags were designed and their spectral properties (UV-vis spectrophotometry, fluorescence, circular dichroism) were characterized. Four transduction approaches have been used, a FRET process between two fluorophores acting as a donor/acceptor pair, an excimer emission generation by pyrene tags, a fluorescence modulation by interactions between ethynylpyrene uridine (Upy) fluorescent labels, and a generation of fluorescent silver nanoclusters (AgNCs) on a DNA matrix. To gain insight into the probe-monolayer interactions and to estimate the impact of monolayer on the probe performance with metal cations, the π-A isotherms for the DODAB monolayer in the presence of probes were analyzed and fluorescence spectra of the probe/DODAB complexes at the water/air interface were recorded with a fiber optics accessory. The final stage of the research was devoted to examine the ability the most promising probe/DODAB systems (Ch(F-TBA-T), Ch(py-TBA-py)) for anchoring at the surface of the biological membrane (HeLa cells). The research included in the presented PhD thesis is a completely novel approach considering both the study of quadruplex DNA using the Langmuir technique and the, photophysical investigation of fluorescent probes at the air/water interface.","abstract_html":"Tematyka rozprawy doktorskiej skupia się na opracowaniu i charakterystyce fluorescencyjnych sond do monitorowania jonów potasu, bazujących na strukturze G-kwadrupleksu (G4 DNA) z wykorzystaniem techniki Langmuira. Zaprojektowano i scharakteryzowano spektroskopowo (spektrofotometria UV-vis, fluorescencja, dichroizm kołowy) oligonukleotydowe sondy fluorescencyjne, znakowane hydrofobowym ugrupowaniem (kotwica cholesterolowa) oraz znacznikami fluorescencyjnymi (FRET, py, Upy i AgNCs). Badania spektralne, potwierdziły, że tak zaprojektowane układy analityczne generują sygnał analityczny w obecności kationów metali alkalicznych i wykazują wyższą czułość w stosunku do jonów K+ (w porównaniu z jonami Na+). Rejestracja izoterm π-A dla monowarstwy DODAB w obecności sond oraz widm fluorescencyjnych kompleksów sonda/DODAB na granicy faz woda/powietrze techniką światłowodową, pozwoliły uzyskać wgląd w procesy interakcji sonda-monowarstwa i oszacować oddziaływanie sondy z kationami metali. Końcowym etapem badań było monitorowanie jonów K+ przy powierzchni błony biologicznej (komórki HeLa) w oparciu o najbardziej obiecujące układy sonda/DODAB (Ch(F-TBA-T), Ch(py-TBA-py)). Z sukcesem udało się zaobserwować, że badane sondy mają potencjał jako biosensory do detekcji jonów K+. Badania zawarte w niniejszej rozprawie doktorskiej są przedsięwzięciem całkowicie nowatorskim, zarówno w aspekcie badania kwadrupleksowego DNA techniką Langmuira, jak i w obszarze prowadzenia badań fotofizycznych sond na granicy faz monowarstwa/faza wodna. The subject of the doctoral dissertation focuses on the development and characterization of fluorescent probes for monitoring potassium ions, which are based on the G-quadruplex (G4 DNA) structure and are investigated in bulk solution as well as using the Langmuir technique. Oligonucleotide fluorescent probes labeled with a hydrophobic moiety (cholesterol anchor) and fluorescent tags were designed and their spectral properties (UV-vis spectrophotometry, fluorescence, circular dichroism) were characterized. Four transduction approaches have been used, a FRET process between two fluorophores acting as a donor/acceptor pair, an excimer emission generation by pyrene tags, a fluorescence modulation by interactions between ethynylpyrene uridine (Upy) fluorescent labels, and a generation of fluorescent silver nanoclusters (AgNCs) on a DNA matrix. To gain insight into the probe-monolayer interactions and to estimate the impact of monolayer on the probe performance with metal cations, the π-A isotherms for the DODAB monolayer in the presence of probes were analyzed and fluorescence spectra of the probe/DODAB complexes at the water/air interface were recorded with a fiber optics accessory. The final stage of the research was devoted to examine the ability the most promising probe/DODAB systems (Ch(F-TBA-T), Ch(py-TBA-py)) for anchoring at the surface of the biological membrane (HeLa cells). The research included in the presented PhD thesis is a completely novel approach considering both the study of quadruplex DNA using the Langmuir technique and the, photophysical investigation of fluorescent probes at the air/water interface.","abstract_has_math":false,"creators":["Świtalska, Angelika"],"institution":null,"degree_name":null,"degree_level":null,"degree_discipline":null,"degree_department":null,"school":null,"contributors":[],"advisors":[],"committee_chairs":[],"committee_members":[],"year":2019,"date_issued":"2019","date_published":"2019","updated_at":"2026-07-27T18:44:59Z","subjects":["G-kwadrupleks","monowarstwy Langmuira","sondy fluorescencyjne","detekcja jonów K+","G-quadruplex","Langmuir monolayer","fluorescent probes","detection of K+ ions"],"languages":[],"rights":[],"rights_urls":[],"identifier_entries":[{"key":"dc:identifier","label":"Identifier","values":["hdl:10593/24476"],"render_values":[{"text":"hdl:10593/24476","href":null,"code":true}]}]},"links":{"outbound_url":null,"outbound_label":null,"outbound_source":null},"metadata_groups":[{"id":"academic_context","label":"Academic Context","entries":[{"key":"dc:date.issued","label":"Date","values":["2019"]},{"key":"dc:type","label":"Dc Type","values":["doctoral thesis"]}]},{"id":"subjects_keywords","label":"Subjects and Keywords","entries":[{"key":"dc:subject","label":"Dc Subject","values":["G-kwadrupleks","monowarstwy Langmuira","sondy fluorescencyjne","detekcja jonów K+","G-quadruplex","Langmuir monolayer","fluorescent probes","detection of K+ ions"]}]},{"id":"identifiers","label":"Identifiers","entries":[{"key":"dc:identifier","label":"Identifier","values":["hdl:10593/24476"]}]},{"id":"additional","label":"Additional Metadata","entries":[{"key":"dc:description.other","label":"Dc Description Other","values":["Tematyka rozprawy doktorskiej skupia się na opracowaniu i charakterystyce fluorescencyjnych sond do monitorowania jonów potasu, bazujących na strukturze G-kwadrupleksu (G4 DNA) z wykorzystaniem techniki Langmuira. Zaprojektowano i scharakteryzowano spektroskopowo (spektrofotometria UV-vis, fluorescencja, dichroizm kołowy) oligonukleotydowe sondy fluorescencyjne, znakowane hydrofobowym ugrupowaniem (kotwica cholesterolowa) oraz znacznikami fluorescencyjnymi (FRET, py, Upy i AgNCs). Badania spektralne, potwierdziły, że tak zaprojektowane układy analityczne generują sygnał analityczny w obecności kationów metali alkalicznych i wykazują wyższą czułość w stosunku do jonów K+ (w porównaniu z jonami Na+). Rejestracja izoterm π-A dla monowarstwy DODAB w obecności sond oraz widm fluorescencyjnych kompleksów sonda/DODAB na granicy faz woda/powietrze techniką światłowodową, pozwoliły uzyskać wgląd w procesy interakcji sonda-monowarstwa i oszacować oddziaływanie sondy z kationami metali. Końcowym etapem badań było monitorowanie jonów K+ przy powierzchni błony biologicznej (komórki HeLa) w oparciu o najbardziej obiecujące układy sonda/DODAB (Ch(F-TBA-T), Ch(py-TBA-py)). Z sukcesem udało się zaobserwować, że badane sondy mają potencjał jako biosensory do detekcji jonów K+. Badania zawarte w niniejszej rozprawie doktorskiej są przedsięwzięciem całkowicie nowatorskim, zarówno w aspekcie badania kwadrupleksowego DNA techniką Langmuira, jak i w obszarze prowadzenia badań fotofizycznych sond na granicy faz monowarstwa/faza wodna. The subject of the doctoral dissertation focuses on the development and characterization of fluorescent probes for monitoring potassium ions, which are based on the G-quadruplex (G4 DNA) structure and are investigated in bulk solution as well as using the Langmuir technique. Oligonucleotide fluorescent probes labeled with a hydrophobic moiety (cholesterol anchor) and fluorescent tags were designed and their spectral properties (UV-vis spectrophotometry, fluorescence, circular dichroism) were characterized. Four transduction approaches have been used, a FRET process between two fluorophores acting as a donor/acceptor pair, an excimer emission generation by pyrene tags, a fluorescence modulation by interactions between ethynylpyrene uridine (Upy) fluorescent labels, and a generation of fluorescent silver nanoclusters (AgNCs) on a DNA matrix. To gain insight into the probe-monolayer interactions and to estimate the impact of monolayer on the probe performance with metal cations, the π-A isotherms for the DODAB monolayer in the presence of probes were analyzed and fluorescence spectra of the probe/DODAB complexes at the water/air interface were recorded with a fiber optics accessory. The final stage of the research was devoted to examine the ability the most promising probe/DODAB systems (Ch(F-TBA-T), Ch(py-TBA-py)) for anchoring at the surface of the biological membrane (HeLa cells). The research included in the presented PhD thesis is a completely novel approach considering both the study of quadruplex DNA using the Langmuir technique and the, photophysical investigation of fluorescent probes at the air/water interface."]},{"key":"dc:title","label":"Title","values":["Fluorescencyjne sondy oligonukleotydowe oparte na strukturze G-kwadrupleksu, ich charakterystyka i oddziaływanie z monowarstwą Langmuira"]}]}],"canonical_facts":{"dc:date.issued":["2019"],"dc:description.other":["Tematyka rozprawy doktorskiej skupia się na opracowaniu i charakterystyce fluorescencyjnych sond do monitorowania jonów potasu, bazujących na strukturze G-kwadrupleksu (G4 DNA) z wykorzystaniem techniki Langmuira. Zaprojektowano i scharakteryzowano spektroskopowo (spektrofotometria UV-vis, fluorescencja, dichroizm kołowy) oligonukleotydowe sondy fluorescencyjne, znakowane hydrofobowym ugrupowaniem (kotwica cholesterolowa) oraz znacznikami fluorescencyjnymi (FRET, py, Upy i AgNCs). Badania spektralne, potwierdziły, że tak zaprojektowane układy analityczne generują sygnał analityczny w obecności kationów metali alkalicznych i wykazują wyższą czułość w stosunku do jonów K+ (w porównaniu z jonami Na+). Rejestracja izoterm π-A dla monowarstwy DODAB w obecności sond oraz widm fluorescencyjnych kompleksów sonda/DODAB na granicy faz woda/powietrze techniką światłowodową, pozwoliły uzyskać wgląd w procesy interakcji sonda-monowarstwa i oszacować oddziaływanie sondy z kationami metali. Końcowym etapem badań było monitorowanie jonów K+ przy powierzchni błony biologicznej (komórki HeLa) w oparciu o najbardziej obiecujące układy sonda/DODAB (Ch(F-TBA-T), Ch(py-TBA-py)). Z sukcesem udało się zaobserwować, że badane sondy mają potencjał jako biosensory do detekcji jonów K+. Badania zawarte w niniejszej rozprawie doktorskiej są przedsięwzięciem całkowicie nowatorskim, zarówno w aspekcie badania kwadrupleksowego DNA techniką Langmuira, jak i w obszarze prowadzenia badań fotofizycznych sond na granicy faz monowarstwa/faza wodna. The subject of the doctoral dissertation focuses on the development and characterization of fluorescent probes for monitoring potassium ions, which are based on the G-quadruplex (G4 DNA) structure and are investigated in bulk solution as well as using the Langmuir technique. Oligonucleotide fluorescent probes labeled with a hydrophobic moiety (cholesterol anchor) and fluorescent tags were designed and their spectral properties (UV-vis spectrophotometry, fluorescence, circular dichroism) were characterized. Four transduction approaches have been used, a FRET process between two fluorophores acting as a donor/acceptor pair, an excimer emission generation by pyrene tags, a fluorescence modulation by interactions between ethynylpyrene uridine (Upy) fluorescent labels, and a generation of fluorescent silver nanoclusters (AgNCs) on a DNA matrix. To gain insight into the probe-monolayer interactions and to estimate the impact of monolayer on the probe performance with metal cations, the π-A isotherms for the DODAB monolayer in the presence of probes were analyzed and fluorescence spectra of the probe/DODAB complexes at the water/air interface were recorded with a fiber optics accessory. The final stage of the research was devoted to examine the ability the most promising probe/DODAB systems (Ch(F-TBA-T), Ch(py-TBA-py)) for anchoring at the surface of the biological membrane (HeLa cells). The research included in the presented PhD thesis is a completely novel approach considering both the study of quadruplex DNA using the Langmuir technique and the, photophysical investigation of fluorescent probes at the air/water interface."],"dc:identifier":["hdl:10593/24476"],"dc:subject":["G-kwadrupleks","monowarstwy Langmuira","sondy fluorescencyjne","detekcja jonów K+","G-quadruplex","Langmuir monolayer","fluorescent probes","detection of K+ ions"],"dc:title":["Fluorescencyjne sondy oligonukleotydowe oparte na strukturze G-kwadrupleksu, ich charakterystyka i oddziaływanie z monowarstwą Langmuira"],"dc:type":["doctoral thesis"]},"updated_at":"2026-07-27T18:44:59Z"}