Analiza zależności między maszynerią biogenezy mikroRNA a spliceosomem u roślin
type: CreativeWork
description: mikroRNA (miRNA) są kluczowym elementem regulacji ekspresji genów. Te krótkie jednoniciowe fragmenty RNA regulują poziom białek poprzez cięcie docelowych mRNA bądź hamowanie ich translacji. Biogeneza miRNA u roślin jest bardzo skomplikowanym i wciąż nie do końca poznanym procesem, zachodzącym na terenie jądra komórkowego. Dotychczasowe doniesienia literaturowe wskazują na niezwykle istotną zależność wydajności biogenezy miRNA od wycinania intronów, znajdujących się w ich prekursorach. Nie scharakteryzowano jednak do tej pory elementów komórkowych odpowiedzialnych za tą regulację. W niniejszej pracy wykazano bezpośrednie oddziaływanie między SERRATE (SE), jednym z głównych białek maszynerii biogenezy miRNA, i obydwiema podjednostkami jądrowego kompleksu wiążącego czapeczkę (AtCBC, ang. cap binding complex). Kompleks SE/AtCBC stanowi podstawę molekularnego mechanizmu odpowiedzialnego za rolę SE i AtCBC w regulacji splicingu pre-mRNA i biogenezy miRNA. Zidentyfikowano również bezpośrednie oddziaływania między SE i czterema pomocniczymi białkami kompleksu snRNP U1, tj. AtPRP39b, AtPRP40a, AtPRP40b i AtLUC7rl. W linii A. thaliana se-2, w której obecna wersja SE pozbawiona jest zdolności do kontaktu z białkami snRNP U1, odnotowano zmiany splicingu i wydajności biogenezy miR1888a w stosunku do roślin z aktywnym połączeniem SE-snRNP U1. W niniejszej pracy zaproponowano model przyłączania się białek zaangażowanych w biogenezę miRNA do ich pierwotnych prekursorów, w którym SE pełni rolę platformy łączącej elementy mikroprocesora, spliceosomu i kompleksu wiążącego czapeczkę. (miRNAs) are key components of the gene expression regulation. These single-stranded RNAs regulate the protein levels by cleavage of mRNA or translation inhibition. Plant microRNA biogenesis is a very complex, and still not fully understood process, that occurs in the cell nucleus. Until now, an interplay between miRNA biogenesis and splicing of introns located in miRNA precursors has been reported. Howeve…
abstract: mikroRNA (miRNA) są kluczowym elementem regulacji ekspresji genów. Te krótkie jednoniciowe fragmenty RNA regulują poziom białek poprzez cięcie docelowych mRNA bądź hamowanie ich translacji. Biogeneza miRNA u roślin jest bardzo skomplikowanym i wciąż nie do końca poznanym procesem, zachodzącym na terenie jądra komórkowego. Dotychczasowe doniesienia literaturowe wskazują na niezwykle istotną zależność wydajności biogenezy miRNA od wycinania intronów, znajdujących się w ich prekursorach. Nie scharakteryzowano jednak do tej pory elementów komórkowych odpowiedzialnych za tą regulację. W niniejszej pracy wykazano bezpośrednie oddziaływanie między SERRATE (SE), jednym z głównych białek maszynerii biogenezy miRNA, i obydwiema podjednostkami jądrowego kompleksu wiążącego czapeczkę (AtCBC, ang. cap binding complex). Kompleks SE/AtCBC stanowi podstawę molekularnego mechanizmu odpowiedzialnego za rolę SE i AtCBC w regulacji splicingu pre-mRNA i biogenezy miRNA. Zidentyfikowano również bezpośrednie oddziaływania między SE i czterema pomocniczymi białkami kompleksu snRNP U1, tj. AtPRP39b, AtPRP40a, AtPRP40b i AtLUC7rl. W linii A. thaliana se-2, w której obecna wersja SE pozbawiona jest zdolności do kontaktu z białkami snRNP U1, odnotowano zmiany splicingu i wydajności biogenezy miR1888a w stosunku do roślin z aktywnym połączeniem SE-snRNP U1. W niniejszej pracy zaproponowano model przyłączania się białek zaangażowanych w biogenezę miRNA do ich pierwotnych prekursorów, w którym SE pełni rolę platformy łączącej elementy mikroprocesora, spliceosomu i kompleksu wiążącego czapeczkę. (miRNAs) are key components of the gene expression regulation. These single-stranded RNAs regulate the protein levels by cleavage of mRNA or translation inhibition. Plant microRNA biogenesis is a very complex, and still not fully understood process, that occurs in the cell nucleus. Until now, an interplay between miRNA biogenesis and splicing of introns located in miRNA precursors has been reported. Howeve…
author: Stępień, Agata
keywords: mikroRNA, splicing, Arabidopsis, SERRATE, snRNP U1
date published: 2016
date modified: 2026-07-27T18:44:59Z
provider: Poznan
publisher: Networked Digital Library of Theses and Dissertations
type: WebPage
source organization: Poznan