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Results
Showing 1 to 20 of 40 for “"snRNP"”.
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Co-transcriptional recruitment of the U1 snRNP
… In my thesis, I address: 1) whether the U1 snRNP, which binds to the 5¡¦ splice site of each intron, is recruited co-transcriptionally in vivo and 2) if so, where along the length of active genes the U1 snRNP is concentrated. U1 snRNP accumulates on downstream positions of genes containing …
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The role of U1 and snRNP in pre-mRNA splicing
Thesis (Ph. D.)--Massachusetts Institute of Technology, Dept. of Biology, 1996.
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Struktur-Funtionsbeziehung in den spleißosomalen Proteinen des U4/U6•U5 tri-snRNP
Gegenstand der vorliegenden Arbeit ist der spleißosomale U5-Partikel. Beschrieben werden Untersuchungen funktionaler Beziehungen, die biochemisch mittels limitierter Proteolysen und spektrometrischer Messungen durchgeführt wurden, da die direkte Strukturanalyse des Spleißosoms aufgrund seiner hohen …
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Interaction of Spliceosomal U2 snRNP Protein p14 with Its Branch Site RNA Target
<p>Newly transcribed precursor messenger RNA (pre-mRNA) molecules contain coding sequences (exons) interspersed with non-coding intervening sequences (introns). These introns must be removed in order to generate a continuous coding sequence prior to translation of the message into protein. The …
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Enzymatic Disassembly of Promoter Bound 7SK snRNP Drives Transcription Elongation of HIV and Cellular Genes
… to the 7SK small nuclear ribonucleoprotein (snRNP). In the absence of stimuli, the 7SK snRNP resides in both the nucleoplasm and promoter regions. However, an understanding of how TF’s capture P-TEFb from the 7SK snRNP at the promoter and the mechanism and purpose of localizing the 7SK snRNP …
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Investigation of Protein-protein Interactions within the Human Spliceosomal U4/U6.U5 tri-snRNP Particle
… Proteinen des U5, wie auch des U4/U6 snRNPs. Es kann daher als potentiell brückenbildendes oder vernetzendes Protein bei der Formation oder der strukturellen Stabilisierung des tri-snRNPs gesehen werden. Die stabile Integration des 102K Proteins in das U5 snRNP wird über Interaktionen …
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Discrete elements of the U2 snRNP regulate its intranuclear trafficking and recruitment to nascent transcripts
… study, I characterize the elements of the U2 snRNP that control its intranuclear trafficking and association with nascent transcripts. Through a mutational analysis, I demonstrate that stem loops 3 and 4 (SL3 and SL4) are both required for U2 snRNP association with nascent transcripts and …
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Promoter directionality is controlled by U1 snRNP and polyadenylation signals in mouse embryonic stem cells
… that an asymmetric distribution of encoded U1 snRNP binding sites (U1 sites or 5' splice sites) and PASs surrounding gene transcription start sites (TSSs) enforce promoter directionality by ensuring uaRNAs are prematurely terminated and likely subsequently degraded. Together, these studies …
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Biochemische und zellbiologische Untersuchungen zur Rolle der Cajal Bodies bei der Zusammenlagerung spleißosomaler UsnRNP Partikel
… Spleißen katalysiert, stellt das [U4/U6.U5] tri-snRNP-Partikel dar, das durch die Zusammenlagerung des U4/U6 di-snRNP mit dem U5 snRNP-Monopartikel entsteht und als vorassemblierter Komplex in das Spleißosom integriert wird. Dramatische strukturelle Umlagerungsprozesse im Verlauf des …
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Purification and crystallization of spliceosomal snRNPs
… Spleißosoms sind die Ribonukleoproteinpartikel (snRNPs) U1, U2, U4, U5 und U6. Neben der U1 small nuclear RNA (snRNA) enthält das U1 snRNP drei partikel-spezifische Proteine, U1-A, U1-70k und U1-C. Des weiteren findet man einen Satz von sieben Proteinen, den Sm-Proteinen, die auch in anderen …
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Crystal structure of a human U5 snRNP specific binary complex and crystal structure of a histone deacetylase-like bacterial amidohydrolase
… Hefe als auch beim Menschen Bestandteil der U5 snRNPs, welche am Spleißen von mRNAs beteiligt sind. Weiterhin spielt U5-52K als CD2 Rezeptor-Bindeprotein 2 (CD2BP2) eine Rolle bei der Immunantwort, da es mit seiner GYF-Domäne spezifisch an ein prolinreiches Sequenzmotiv der zytoplasmatischen …
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Investigation of the higher order structure of the spliceosomal RNA network
… räumliche Anordnung der beteiligten U1 und U2 snRNPs in frühen spleißosomalen Komplexen ist wenig bekannt. Beide snRNPs, zusammen mit weiteren nicht-snRNP Proteinen, sind in der korrekten Positionierung der für das Spleißen wichtigen funktionellen Bereiche der prä-mRNA involviert. Um die …
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Elektronenmikroskopische 3D Strukturbestimmung des Spleißosoms
… der prä-mRNA jeweils neu aus den fünf snRNPs (`small nuclear ribonulceoprotein particles´) und weiteren Faktoren aufgebaut. Der spleißosomale Komplex A, bestehend aus U1 und U2 snRNP, verbindet sich mit dem U4/U6.U5 tri-snRNP, einem Komplex der U4, U5, U6 snRNPs, um den …
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Context-Dependent Function of the Splicing Factor hnRNP L
… spliceosome is made up of 5 small nuclear RNP (snRNP) complexes (U1, U2, U4/U6, and U5), all of which consist of a uridine-rich snRNA and multiple proteins. Importantly, the spliceosome is not a pre-formed enzyme but instead forms through the step-wise assembly of the snRNP complexes on the …
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Identificação de parceiros de interação para a cinease reguladora de splicing SRPK2
… uma cinase reguladora de fatores de splicing não-snRNPs (proteínas SR), e de fatores snRNPs (U4⁄U6-U5 tri-snRNP). SRPK2 regula as proteínas SR fosforilando-as em seus resíduos de serina e recrutando- as para a formação do spliceossomo, enquanto atua na formação do complexo U4⁄U6- U5 tri-snRNP, …
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Molecular Mechanisms of Alternative Splicing Regulation: An Investigation of the Spliceosome Repressed by Hnrnp L on Cd45 Exon 4
… consists mainly of the U1, U2, U4, U5 and U6 snRNP, and about a hundred of non-snRNP proteins. Splicing regulators that bind to enhancer or silencer elements on the pre-mRNA can alter assembly of these spliceosome components. Understanding how splicing regulators control spliceosome assembly …
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Electron microscopic localization of tagged proteins in the yeast S. cerevisiae spliceosomal U4/U6.U5 trisnRNP
… den sogenannten U1, U2, U5 und U4/U6 snRNPs sowie zahlreichen nicht-snRNP Spleißfaktoren assembliert. Die snRNPs bestehen aus einem RNA-Molekül (bzw. zwei weitgehend basengepaarten RNAs im Fall von U4/U6) und mehreren Proteinkomponenten. Die Assemblierung des Spleißosoms beginnt mit …
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Kristallstrukturanalyse des spleißosomalen DEAD-Box Proteins hPrp28
… DEAD-Box Protein hPrp28 ist Bestandteil des U5 snRNP des humanen Spleißosoms. Es ist notwendig für die Integration des U4/U6.U5 tri-snRNP in diesen makromolekularen Komplex und die anschließend stattfindende Konformationsänderung, die zum aktiven Spleißosom und zur ersten Transester-Reaktion …
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