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Showing 1 to 20 of 29 for “"Genomas"”.
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Análise comparativa de transposons classe II (CACTA e Mutator) nos genomas de Vigna unguiculada, Phaseolus vulgaris e Medicago truncatula
… já estudados. Constituem parte abundante dos genomas, influenciando em sua estrutura e atividade de diversas maneiras. Dessa forma, conhecer a composição e a distribuição de TEs em leguminosas como Vigna unguiculata, Phaseolus vulgaris e Medicago truncatula é parte importante do conhecimento …
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Aplicación de estrategias basadas en la secuenciación de genomas para la activación de la producción de nuevos compuestos bioactivos en Streptomyces spp
… un 75 % de la producción. La secuenciación de genomas ha puesto de manifiesto su potencial productor, ya que contienen un elevado número de agrupamientos génicos destinados al metabolismo secundario, superior al número de metabolitos detectados en condiciones experimentales. La minería genómica …
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Análises in silico das proteínas de superfície e secretadas de Staphylococcus aureus para discriminar entre as mastites bovina clínica e subclínica
… que frequentemente evolui para a cronicidade. Os genomas de quatro isolados de S. aureus causadores de mastite bovina subclínica (170, 302, 1269, 1364) foram sequenciados por nosso grupo e foram contrastados com os genomas de duas cepas isoladas de mastite clínica (S. aureus RF122 e S. aureus …
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Identificación y caracterización de agrupamientos de genes de biosíntesis de compuestos derivados de hidroxibenzoatos en Streptomyces
… En los últimos años la secuenciación de los genomas de estas bacterias ha revelado que poseen un potencial mayor del esperado como productores de compuestos bioactivos, lo que ha llevado a utilizar la minería genómica como estrategia bioinformática para identificar agrupaciones de genes de …
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Identificação e caracterização estrutural de proteínas com domínio lectina em fungos patogênicos em uma ánalise in silico
… O fornecimento de sequências completas de genomas de fungos patogênicos possibilita a caracterização e exploração de dados in silico para prever estruturas e funções de proteínas de diversas espécies. Com o objetivo de identificar e caracterizar estruturalmente domínios lectina conservados …
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Interação funcional, expressão de genes e filogenia entre proteínas de membrana de Rickettsia spp. e carrapatos
… genes e proteínas potencialmente codificadas nos genomas de ambos os organismos. Tratando-se de uma relação em nível molecular, buscamos predizer as interações, ativação da expressão de genes e coevolução entre os repertórios de proteínas destes organismos. Para avaliar a hipótese de interação, …
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Identificación y caracterización de agrupaciones de genes de biosíntesis para péptidos no ribosomales en Streptomyces sp. CS113
… últimos años, gracias a la secuenciación de sus genomas, se ha descubierto que poseen una potencialidad productora mayor de lo esperado, lo que ha llevado a utilizar la minería genómica (genome mining) como estrategia para identificar agrupaciones de genes (BGCs) que codifiquen nuevos compuestos. …
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1q21.1 syndrome: A perspective on Structural Variant detection & the evolutionary profile of associated protein domains
… long reads. El proyecto incluye la simulación de genomas con diversas variantes estructurales y la simulación de reads de secuenciación que permitan validar la aplicación de este pipeline. El segundo objetivo es analizar la filogenia de los dominios Olduvai durante la evolución. Los resultados …
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Análisis Metagenómico del Viroma Intestinal en Pacientes Intrahospitalarios y de Unidad de Cuidados Intensivos de Bogotá, Colombia
… intrahospitalario. De los profagos detectados en Genomas Ensamblados a partir de Metagenomas (MAGs) bacterianos, llamó la atención la presencia de dos familias virales (Myoviridae y Siphoviridae) en la misma especie bacteriana, Alistipes putredinis. Los resultados sugieren que las interacciones …
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Predição de proteínas sensoras baseadas em bacteriófagos para detecção de Salmonella spp.
… no GenBank (NCBI) até 09 dezembro de 2023. Os genomas foram submetidos à anotação funcional para identificar proteínas de cauda responsáveis pelo reconhecimento do hospedeiro. As sequências das proteínas selecionadas foram comparadas para procurar regiões conservadas e foram agrupadas. …
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Estudo de virulência de Salmonella spp. isolados de linfonodos mesentéricos suinos: uma abordagem utilizando o sequenciamento de genoma completo
… se mostraram bem conservados em todos os genomas estudados. Assim, a constante investigação de Salmonella em suínos fornece dados para subsidiar respostas ligados ao aspecto epidemiológico do agente. Além disso, estudo genéticos como, por exemplo, a pesquisa de genes de virulência auxiliam …
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Efecto del uso, manejo y región geográfica sobre los genes del ciclo del carbono y nitrógeno de la comunidad edáfica en dos regiones del Valle del Cauca
… basan sus predicciones en la presencia de genomas completos y disponibles relacionados cercanamente a los taxones identificados por el 16S rRNA. En consecuencia, estos métodos funcionan mejor en ambientes con alto número de genomas secuenciados como los estudios del microbioma del ser …
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RNAi em Colletotrichum lindemuthianum: caracterização das proteínas-chave e desafios para a aplicação
… que os genes que as codificam foram mantidos nos genomas, com maior proximidade entre espécies do mesmo complexo taxonômico do gênero Colletotrichum. A expressão dos genes AGO1, RdRP3 e DCL1 do fungo na interação com a planta variou ao longo do tempo e da linhagem avaliada. Foram obtidos 18 e 180 …
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Species diversity, genetic structure and variability of begomovirus populations infecting tomatoes in Ecuador
… em 2010 e 2011 em seis províncias do Equador, e genomas completos de begomovírus foram clonados e sequenciados utilizando-se uma estratégia baseada em amplificação por círculo rolante. Nenhuma amostra positiva para begomovírus foi detectada nas províncias de Chimborazo e Galápagos. A absoluta …
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Desarrollo de técnicas de computación evolutiva : multiobjetivo y aprendizaje automático para la inferencia, modelado y simulación de redes regulatorias
… de datos de expresión de genes, a nivel de genomas completos. Una red regulatoria de genes es una colección de segmentos de ADN (ácido desoxirribonucleico) en una célula que interactúan unos con otros (indirectamente a través del producto de su expresión) y con otras sustancias en la célula, …
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Organização cromossômica e dinâmica evolutiva de sequências repetitivas em formigas cultivadoras de fungos (Myrmicinae: Attini: Attina)
… altas taxas de rearranjos estruturais em seus genomas, com contrações e expansões gênicas, que foram necessárias para o estabelecimento de seu estilo de vida baseado em sociedades agrícolas. Processos que levaram a diversificação genômica em Attina também podem ter atuado sobre sequências …
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Diversidad de bacterias con potencial de producir fitohormonas en cianolíquenes peltigera del Sur de Chile
… de distintas fitohormonas dentro de los metagenomas bacterianos predichos con PICRUSt2. Se pudo determinar que las bacterias asociadas a los líquenes Peltigera de este estudio tienen el potencial de producir ácido indol acético, citoquininas, giberelinas, ácido salicílico y etileno, mientras …
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Genoma mitocondrial no estudo filogenético de carrapatos pertencentes às famílias Ixodidae e Argasidae
… a abordagem filogenômica e o estabelecimento de genomas mitocondriais completos, como estratégias moleculares, foram de fundamental importância na inferência filogenética de carrapatos pertencentes às famílias Ixodidae e Argasidae, como também, no estudo sobre a associação evolutiva entre o N. …
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Caracterização Genômica de bactérias nitrificantes heterotróficas/desnitrificantes aeróbias visando a identificação de genes marcadores
… estudo teve como objetivo a caracterização dos genomas de quatro linhagens bacterianas NH/DA: Pseudomonas stutzeri UFV5; Rhodococus ruber UFV2; Pseudomonas balearica UFV3 e Gordonia amicalis UFV4, que foram submetidos à genômica comparativa para a identificação de genes envolvidos em vias …
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Activación de rutas de biosíntesis silenciosas en Streptomyces albus J1074
… antivirales, etc.). La secuenciación masiva de genomas bacterianos ha puesto de manifiesto que algunos grupos presentan un potencial oculto para la producción de nuevas moléculas bioactivas previamente desconocidas y determinadas por agrupaciones génicas silenciosas. En concreto, los …
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