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Results
Showing 1 to 20 of 21 for “"Docking molecular"”.
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Cribado in silico de una librería de nutracéuticos para identificar posibles tratamientos del virus SARS-CoV-2 mediante docking molecular
… se lleva a cabo un screening virtual basado en docking molecular mediante un software local y un servidor en línea. En primer lugar, se obtuvieron a partir de diferentes bases de datos, una librería de nutracéuticos, una librería de señuelos y las estructuras cristalinas de dos dianas …
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Desenvolvimento de uma abordagem híbrida inteligente para estimação de docking molecular entre proteínas utilizando redes de pseudo-convolução e Random Forests
Docking molecular é uma técnica computacional utilizada para prever como duas moléculas, geralmente uma proteína e um ligante, interagem entre si. Essa técnica simula o encaixe da molécula menor (ligante) no sítio ativo da molécula maior (proteína), permitindo a análise de afinidade e …
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Aplicação de microrganismos lipolíticos em alimentos e na biodegradação de poliuretanos
… monômeros e tetrâmeros de PU para realizar o docking molecular com a poliuretanase modelada e validada de S. liquefaciens. Foi possível verificar que os PU ligaram ao resíduo de aminoácido S207, que faz parte da tríade catalítica e é responsável pela ação hidrolítica da poliuretanase. Os …
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Estudo teórico conformacional da delta-toxina e teórico-experimental da interação de complexos de cobre-base de Schiff com o canal iônico da alfa-toxina de Staphylococcus aureus/
… dos compostos. Finalmente, avaliou-se através de docking molecular a interação entre os compostos e o canal de α-HL, visando corroborar o mecanismo de bloqueio. No estudo da δ-toxina, dinâmica molecular foi usada para determinar sua conformação em solução aquosa. Observou-se que os complexos de …
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Refinement of the Docking Component of Virtual Screening for PPAR
… bind to PPAR" (i.e. binders) using computational docking methods has proven difficult given the large binding cavity of the protein, which yields a large target area and variations in ligand positions within the binding site. We applied a combined computational and experimental concept for …
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Planejamento e síntese de derivados triazólicos de biofenol como candidatos a novos fármacos e agroquímicos
… das estruturas através do conceito de hibridação molecular e do cálculo dos parâmetros de drug-likeness e agrochemical-likeness. Foram obtidos 15 derivados inéditos do Tirosol, devidamente caracterizados pelas técnicas de RMN de 1 H e 13 C. Os compostos da série foram posteriormente avaliados como …
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Avaliação da atividade antineoplásica e imunomoduladora in vitro e estudos in silico de compostos piridil-tiazolínicos
… e IL-17 (p>0.05). Nos ensaios in silico, o docking molecular apresentou uma média de 1264,47 kcal/mol, indicando que o processo de ligação pode ocorrer de forma espontânea, caracterizando uma boa estabilidade de ligação ao composto. No geral, os resultados deste estudo incentivam …
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Conceptual Framework and Methodology for Analysing Previous Molecular Docking Results
… on in-silico computational simulations such as molecular docking. Molecular docking models biochemical interactions to predict where and how two molecules would bind. The results of large-scale molecular docking simulations can provide valuable insight into the relationship between two …
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Optimización de insecticidas de uso doméstico: Activos alternativos a los Piretroides y Sinergistas en la formulación
… virtual (Virtual Screening, VS) y modelado molecular para identificar alternativas a los piretroides, que son los principales insecticidas neurotóxicos actualmente utilizados. El trabajo se contextualiza dentro del marco regulatorio establecido por el Reglamento de Productos Biocidas (BPR) …
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Structural Characterization of the Flavonoid Enzyme Complex
… synthase (CHS) alleles and to define the molecular basis of the interaction between CHS and the second enzyme of flavonoid biosynthesis, chalcone isomerase (CHI). CHS proteins encoded by five previously characterized alleles were characterized by homology modeling in an effort to explain …
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Enhancing Molecular Docking with Deep Q-Networks
… correspondientes. Por este motivo, simulaciones moleculares por computador, conocidas como Virtual Screening (VS) (o Cribado Virtual), se utilizan a menudo para predecir los candidatos a fármacos durante las primeras etapas de su desarrollo. Uno de los métodos más utilizados en el VS es el …
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Indução do mecanismo de quorum sensing por autoindutor-1 em Salmonella enterica e prospecção de inibidores
… e anti-inflamatórios não esteroides (AINEs) por docking molecular também mostrou que a maioria dos compostos analisados foi capaz de ligar a proteína SdiA de Salmonella, com destaque para o Z-fitol e o lonazolaco. Os resultados do presente trabalho indicam caminhos para determinar as vias e, ou …
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Avaliação do perfil de citocinas séricas e efeito imunomodulador in vitro de um novo derivado tiazolidínico LPSF/JB-20 em pacientes portadores de espondilite anquilosante
… Ensaios de diferenciação adipogênica e modelagem molecular foram avaliadas para determinar o mecanismo de ação ao PPARγ. Os resultados mostram que a expressão de sOSMR, sGP130 e IL-18BP estava significativamente reduzida e a de IL-18 elevada, comparado com voluntários sadios. A expressão da OSM …
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Mechanisms and measurements of sialidase in pneumonia
… were used to verify the experimental results: molecular modelling and molecular docking. Molecular modelling was used to calculate the free energy of the reaction between NanA and MUANA and to compare to the free energy obtained by the experimental data. However, only one of the two required …
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Estudos de modelagem molecular da piperina e CYP3A4 : a influência na biodisponibilidade de fármacos
… as spice and in popular medicine. We present a molecular docking study supporting experimental data about the enhance in bioavailability of propranolol, theophylline, phenytoin, nevirapine, rifampicin, nimesulide, pyrazinamide , carbamazepine, and spartein in the presence of piperine. The …
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COMPUTATIONAL ENZYME ENGINEERING: FROM MOLECULAR MODELING TO MACHINE LEARNING
… rely on sustainable and efficient strategies for molecular synthesis, driving the growing importance of biocatalysis in modern life sciences. Enzymes, as highly selective and efficient natural catalysts, offer significant advantages for environmentally benign and carbon-neutral processes. However, …
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A computational approach for identification and development of novel inhibitors targeting viral polymerases
… i)the knowledge of pathological, cellular and molecular mechanism involved in the disease; and ii)the identification of macromolecule (i.e possible drug target) involved in pathological pathways, their 3D structures and their functions. The biological activity of drug molecules is dependent on …
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Improving Posing and Ranking of Molecular Docking
Molecular docking is a computational tool commonly applied in drug discovery projects and fundamental biological studies of protein-ligand interactions. Traditionally, molecular docking is used to address one of three following questions: (i) given a ligand molecule and a protein receptor, predict …
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Σχεδιασμός και σύνθεση πεπτιδομιμητικών μορίων με βάση το τριμοριακό σύμπλοκο MHC-πεπτίδιο-TCR
… πειράματα i) μοριακής πρόσδεσης (docking), ii) προσομοιώσεις μοριακής δυναμικής (dynamics) καθώς κ iii) πειράματα κβαντικής μηχανικής/ μοριακής μηχανικής (QM/MM) για να προβλέψουμε τις πιθανές αλληλεπιδράσεις των αναλόγων με τον υποδοχέα TCR. Χρησιμοποιήθηκαν τα λογισμικά πρόγραμμα …
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