Deletions- und Bruchpunktanalyse mittels Southern-Blot-Verfahren bei Familien mit Nephronophthise Typ 1 (NPH1)

Die Juvenile Nephronophthise (NPH) ist eine autosomal-rezessive zystische Nierenerkrankung, die im Alter von ca. 13 Jahren zu terminalem Nierenversagen führt. Das Gen für Nephronophthise Typ 1 (NPHP1) wurde auf dem Chromosom 2q13 identifiziert. Es besteht aus 20 Exonen. Mehr als 80 der Patienten tragen eine 250 kb große homozygote Deletion des NPHP1- Gens, die von beiden Seiten von einer invertierten Duplikation (100 kb) flankiert wird. Alternativ dazu gibt es bei einer weiteren NPH-Familie (F12) eine kürzere mütterliche Deletion im proximalen Bereich. Die Deletionsbruchpunkte waren durch PCR-Analyse postuliert worden. Dabei waren der klassische proximale sowie der gemeinsame distale Deletionsbruchpunkt auf Intervalle zwischen STS- Markern festgelegt worden. Der alternative proximale Bruchpunkt von F12 war zwischen Exon 2 und Exon 3 des NPHP1 Gens eingegrenzt worden. <br>Die im Rahmen dieser Arbeit durchgeführten Southern Blot Analysen sollten die PCR-Daten bestätigen und zur weiteren Charakterisierung der Bruchpunktregion führen. <br>Mit zwei Experimenten konnte gezeigt werden, daß der gemeinsame distale Bruchpunkt weiter telomer liegen muß (in Richtung telomer gelegene invertierte Duplikation, möglicherweise innerhalb dieser) als aufgrund von PCR-Daten bisher vermutet. <br>Der alternative proximale Deletionsbruchpunkt bei Familie 12 konnte durch die erstmalige Detektion eines >33 kb junction fragments und durch die Erstellung einer partiellen Restriktionskarte für diese Region auf einen Bereich von ca. 7 kb eingegrenzt werden. <br>In der Nähe des vermuteten proximalen Bruchpunktes bei F12, zwischen Exon 2 und 3, fand sich ein LINE-1-Element. Dieses autonome Retrotransposon könnte eine potentielle Rolle bei der Entstehung der Deletion bei F12 spielen.

Author dc:creator

• Vetsi, Thalia

Contributors dc:contributor

• Hildebrandt, Friedhelm

• Nephronophthise
• Bruchpunktanalyse
• Nephronophthisis
• southern blot method
• gene
• deletion
• breakpoint analysis

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