Tackling unresolved questions in marine virology: from DNA to RNA viral world

El uso de la metagenómica ha revolucionado el campo de la virología marina, jugando un papel fundamental en lo que conocemos hoy en día de esta disciplina. Sin embargo, a pesar de haber arrojado luz sobre áreas que antes resultaban imposibles de imaginar para la virología ambiental, los estudios metagenómicos presentan algunos sesgos que impiden una comprensión global y detallada de las dinámicas y estructuras del viroma. Entre estos sesgos, destaca la dificultad de ensamblar genomas de poblaciones con una alta microdiversidad, como lo demuestra el descubrimiento del virus vSAG 37-F6. Para ampliar nuestra comprensión del virioplancton, es crucial examinar críticamente las metodologías actuales, con tal de reconocer sus limitaciones y explorar nuevas vías para su mejora o para poder desarrollar metodologías complementarias cuyo uso combinado nos permitan superar estos sesgos. En esta tesis, se ha realizado un análisis comparativo de diferentes metodologías de secuenciación para estudiar el virioplancton, evaluando las fortalezas y debilidades de cada una. Además, se ha abordado el tema hasta ahora poco explorado de los virus de ARN, evaluando su estructura poblacional y su contribución al virioplancton. Finalmente, se ha profundizado en el conocimiento de uno de los virus marinos más abundantes, el pelagífago vSAG 37-F6, a través de estudios temporales y la caracterización y recuperación completa de su genoma mediante la integración de diferentes técnicas de secuenciación.

Author

• Vila-Nistal, Marina

• Microbiología
• Virus
• Ambiente marino
• NGS
• Secuenciación de tercera generación

Identifier

hdl:10045/161083

OAI identifier oai:identifier

oai:rua.ua.es:10045/161083